鱼类中含有丰富的蛋白质、多不饱和脂肪酸且脂肪含量低,是人类获取营养物质的来源之一,但鱼类容易引起过敏反应[1]。鱼类过敏是人体对鱼肉中抗原物质产生的食物不良反应,是八大类食物过敏原之一,在沿海国家因食用鱼而导致过敏的事件很常见,且该过敏也是一种长期存在的病症,严重威胁人们的健康[2]。过敏的途径主要是通过摄食、呼吸以及皮肤接触,可引发患者在胃肠道、呼吸系统和皮肤等部位产生过敏症状,甚至可引发致命的过敏反应[3]。其中,鱼肉的过敏原主要有小清蛋白(parvalbumin, PV)、胶原蛋白和醛缩酶等[4-6],PV被认为是鱼类的主要过敏原,最早在鳕鱼中被被鉴定出来[7],随后,逐渐在大西洋鲑鱼、阿拉斯加鳕鱼等深水鱼类中被鉴定出来[8-10]。
PV是一种水溶性、低分子质量(约为12 kDa)的钙结合蛋白,在肌肉的舒张运动中起着重要作用,在热处理或是暴露于极端pH等条件下,仍可保持其致敏性。近年来,从鱼肉中提取、纯化PV,研究其致敏性成为了研究热点,且发现鱼类一般会存在2~5种PV亚型[3]。目前,通常使用柱层析和盐析法对PV亚型进行分离纯化,如CAI等[11]通过硫酸铵盐析、DEAE-Sepharoses离子交换柱和Sephacry S-200凝胶过滤对赤魟鱼肌浆进行分离得到了PV亚型。尽管经两步柱层析法能分离纯化PV亚型,但色谱柱的容量会限制样品的进样体积,使其纯化效率降低,同时,不同PV亚型的分子质量差别不大,进而加大了分离纯化的难度,故有必要研究新方法对鱼类中PV亚型进行分离。高效液相色谱(high performance liquid chromatography, HPLC)具有高灵敏度、分析速度快等优势,被广泛应用于食品的检测。尺寸排阻色谱法(size exclusion chromatography, SEC)则是一种基于分子的形状和大小不同的特征进行分离纯化的技术。采用HPLC结合SEC分离纯化鱼类中的PV,相比两步层析法而言,具有更高分离和纯化的效率。迄今为止,国内外对PV亚型提取、纯化、表征及过敏性等方面的研究大多集中在海水鱼类中,而我国是淡水鱼养殖和消费大国,虽然也有关于淡水鱼PV的研究,但相对而言起步较晚,且利用HPLC-SEC技术分离纯化淡水鱼PV亚型的研究鲜有报道。
鲢鱼(Hypophthalmichthy molitrix)是我国重要的淡水经济鱼类,在2019年我国淡水养殖产量中位居第二,约为381.03万t[12]。鲢鱼因具有生长迅速、营养价值高、价格低廉等特点而被人们喜爱和食用[13]。因此,本文以鲢鱼背部白色肌肉为研究对象,采用分级盐析、HPLC-SEC、高分辨质谱法来提取、纯化并鉴定鲢鱼中PV的不同亚型,并从蛋白层面研究PV亚型的氨基酸序列和蛋白修饰,以期为淡水鱼类PV亚型的提纯提供一种新方法,同时鉴定出过敏原,为淡水鱼类过敏原的研究提供科学依据。
鲜活鲢鱼购自江西南昌长胜市场,取背部白色肌肉立即实验或保存于-80 ℃。
色谱纯试剂:乙酸铵,北京索莱宝科技有限公司;碘化乙酰胺(iodoacetamide, IAA),美国Bio-Rad公司;甲酸(formic acid, FA)、乙腈(acetonitrile, ACN)、三氯乙酸,赛默飞世尔科技(中国)有限公司;胰蛋白酶,美国Promega公司;赖氨酰肽链内切酶,日本和光纯药工业株式会社;NH4HCO3,美国Sigma公司。
分析纯试剂:二硫苏糖醇(DL-dithiothreitol, DTT)、甘氨酸、三羟甲基氨基甲烷(tris(hydroxymethyl)methyl aminomethane THAM, Tris)、(NH4)2SO4,北京索莱宝科技有限公司;其他试剂均为国产分析纯。
FA1104 N电子分析天平,上海丙林电子科技有限公司;HH-6数显恒温水浴锅,国华电器有限公司;S220SevenCompact台式pH计,梅特勒-托利多仪器(上海)有限公司;SR-AON-50冷冻干燥机,上海舍岩仪器有限公司;D-2000HSM高效液相色谱、U-2910型紫外可见分光光度计,日本Hitachi公司;TSKgel G3000SWXLSEC柱,日本Tosoh公司;Mini-Protean电泳仪,美国Bio-Rad公司;5430R冷冻离心机,德国艾本德公司;MD34透析袋,北京索莱宝科技有限公司;超滤离心管(3 kDa),美国Millipore公司;Q-Exactive质谱仪、Acclaim PepMap 100纳流预柱、Acclaim PepMap RSLC纳流分析柱、EASY-nLC 1000高效液相色谱,赛默飞世尔科技(中国)有限公司。
1.3.1 PV粗提取
参考孙礼瑞等[14]的方法略作修改。取新鲜鲢鱼背部白色肌肉,切成碎块,使用组织捣碎机将其进行捣碎,加入5倍体积溶液(含1 mmol/L DTT、0.5 mmol/L甘氨酸和0.1 mol/L Tris溶液,溶液在4 ℃下预冷),于搅拌器上搅拌30 min,4 ℃静置过夜。然后在4 ℃,7 500 r/min 离心30 min,取上清液进行保存。
1.3.2 PV的纯化
煮沸:将上清液置于95 ℃水浴锅中加热30 min,冷却后于4 ℃,7 800 r/min离心20 min,取上清液备用。
盐析:往上清液中加入(NH4)2SO4至饱和度为60%,于搅拌器上搅拌30 min后4 ℃环境下沉降12 h,然后于4 ℃,7 500 r/min离心30 min,去掉沉淀,收集上清液,并缓慢加入(NH4)2SO4至饱和度为80%,重复上述实验方法,同样去掉沉淀,保留上清液,往上清液中缓慢加入 (NH4)2SO4使饱和度达100%,重复上述实验方法之后收集沉淀。加入超纯水复容,透析36 h,于4 ℃,7 500 r/min离心30 min,以除去不溶物。
1.3.3 PV亚型的分离纯化
参照LIU等[15]方法利用HPLC-SEC分离鲢鱼肌肉中的PV亚型。用50 mmol/L的乙酸铵溶液(pH 6.8)平衡SEC柱。设置参数:检测波长220 nm,流速0.5 mL/min,时间30 min,将收集的目的蛋白溶液超滤脱盐,冻干保存备用。
1.3.4 十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰氨凝胶电泳分析
参照LIU等[16]方法对目的蛋白进行十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰氨凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis, SDS-PAGE)分析。
1.3.5 鲢鱼PV不同亚型的胶内酶解
将1.3.4小节中染色后的鲢鱼PV电泳胶条整齐地从胶上切下来,参照OFFENGENDEN等[17]报道的方法,对胶粒进行胰蛋白酶酶解,使用脱色液(含50% ACN的50 mmol/L的NH4HCO3溶液)和ACN进行脱色和脱水。干燥后加入200 μL 20 mmol/L DTT溶液,55 ℃反应45 min,反应结束后去除多余的DTT溶液,然后加入200 μL 20 mmol/L IAA溶液,在室温避光环境下反应30 min。去液脱水后加100 μL 50 mmol/L NH4HCO3溶液、2 μg的胰蛋白酶与赖氨酰肽链内切酶,37 ℃恒温培养箱中孵育12~16 h,除盐干燥后再用30 μL体积分数为0.1%的FA水溶液复溶,取1 μL样品进行质谱鉴定。
1.3.6 高效液相色谱结合质谱分析PV氨基酸序列
1.3.6.1 液相色谱条件
通过液相色谱系统,对含脱盐肽的溶液进行在线纳米流动液相色谱分析。采用AcclaimR PepMap100 column预柱(C18, 100 μm×5 μm),AcclaimR PepMap RSLC column分析柱(C18, 50 μm×2 μm),进样量:1 μL,流速为220 nL/min。采用逐步梯度洗脱的方法从柱前和分析柱上洗脱肽,流动相A为0.1% FA水溶液,流动相B为0.1% FA-ACN溶液,进样时每个样品进样1次,流动相具体洗脱程序如表1所示:
表1 流动相梯度洗脱程序
Table 1 Mobile phase gradient elution procedure
时间/min流动相A/%流动相B/%09742907307514426519505345258460584
1.3.6.2 质谱条件
质谱(mass spectrometry, MS)检测是由Thermo Q Exactive HF型质谱仪上完成,数据采集通过Xcalibur 2.2 SP1软件操作,一级母离子扫描范围为300~2 000 m/z,分辨率为70 000;选择信号排名前20的多肽进行碎裂,碎裂模式为高能碰撞解离(high energy collision dissociation, HCD),能量为27%。
母离子图谱用Xcalibur软件分析,对肽段序列分析用PEAKS软件完成。设定一级母离子质量误差容忍度为1.0 Da,二级碎片离子质量误差容忍度为0.6 Da。
SEC是一种基于化合物的分子质量大小进行分离的方法,并按分子质量大小的先后顺序被分离[16],故借助HPLC-SEC对盐析后的PV进行分离纯化。经查阅文献可知,采用饱和度为60%~100%的硫酸铵溶液对鲢鱼蛋白溶液进行分级盐析并通过SDS-PAGE分析,发现饱和度为100%硫酸铵溶液所析出的蛋白质纯度会比饱和度为60%与80%的硫酸铵盐析出的蛋白质纯度更高[18],故本实验直接采用HPLC-SEC对饱和度为100%的硫酸铵盐所析出的蛋白质进行分离纯化,经饱和度为100%硫酸铵盐所分离后PV的SEC图如图1所示。由图1可知,盐析后的PV经SEC分离后存在4个特征峰,第I峰可能为PV的多聚体,第II~IV峰为PV的不同亚型,第II、III峰没有完全分离,这可能是由于PV亚型之间的分子质量差别较小,SEC不能准确揭示分子质量的变化,故将这2个峰收集在一起。根据PV在SEC的分布情况,采用SDS-PAGE和高分辨质谱对其进一步确定分子质量及亚型鉴定。
图1 经100%硫酸铵盐析分离后PV的SEC图
Fig.1 SEC diagram of PV after 100% ammonium sulfate salting out separation
经SEC纯化后第I~IV峰的SDS-PAGE图如图2所示。第I峰存在2个条带,其中有1个条带分子质量超过了17 kDa,为PV的二聚体,不符合PV亚型的分子质量范围;第II、III峰由于收集在一起,故也含有2个条带,其分子质量为11 kDa~15 kDa,符合PVI和PVII亚型的分子质量范围。与第I、II、III峰不同的是,第IV峰只有1个条带,其分子质量接近11 kDa,符合所报道的PVIII亚型的分子质量。LIU等[19]从鲢鱼白色肌肉中提取得到3种亚型的分子质量分别为14 kDa、12 kDa、11 kDa,而第I峰另一条带的分子质量虽然在11 kDa左右,但因可能有高分子质量的条带存在,为了避免影响实验结果,尽量减少误差,故本次只对第II~IV峰的PV胶条进行切割、提取,酶解蛋白质后通过高分辨率质谱技术进行测定。
1-marker;2-第I峰条带;3-II、III峰条带;4-IV峰条带
图2 第I~IV峰经SEC纯化后的SDS-PAGE图
Fig.2 SDS-PAGE diagram of the I~IV peak purified by SEC
不同类型的蛋白酶解产物一般会存在差异,通过生物酶切技术与质谱法多肽识别技术研究特征肽段,可鉴定出蛋白质的种类。目前,主要是从分子方面研究鱼类PV的氨基酸序列,而从蛋白层面分析并鉴定其氨基酸序列的报道较少。本研究运用蛋白质酶切技术与液质联用法对多肽进行识别,并在PV亚型氨基酸序列鉴别方面进行了研究。PV亚型的一级质谱图如图3所示,将所得到的质谱数据与蛋白质数据库(https://www.uniprot.org/proteomes/UP000000437)中的小清蛋白亚型肽序列(Q804W2、Q6IMW7和Q9I8V0)以及文献报道的鲢鱼亚型肽序列[20](gi 209902357和gi 209902355)进行匹配,所得的肽序列数据通过Xcalibur软件分析并采用从头测序法(De novo)进行氨基酸序列鉴定。
a-PVI;b-PVII;c-PVIII
图3 PV亚型的一级质谱图
Fig.3 Ion flow diagram of PV isotypes
HPLC-MS/MS鉴定不同亚型PV的氨基酸序列如表2所示。3种PV亚型均能与蛋白质数据库中鱼类PV不同亚型的氨基酸序列进行匹配,其中PVI氨基酸序列与鱼类PV亚型(Q804W2)序列的匹配度最低,仅为74%的匹配率;PVII与鱼类PV亚型(Q6IMW7)的氨基酸序列匹配度最高,达到了完全重合的程度;PVIII与鱼类PV亚型(Q9I8V0)的氨基酸序列有99%的匹配率,进一步说明所纯化分离的PVI、PVII、PVIII均为PV亚型。同时根据质谱情况可得出该3种亚型的平均分子质量分别为12.029 0 kDa、11.581 0 kDa和11.622 0 kDa。另外,基于链长和序列特征,PV一般分为α型和β型,其中α-PV含有108个氨基酸,具有赖氨酸-丙氨酸(Lys-Ala)特征序列,而β-PV则是含有109个氨基酸,在相应位置为丙氨酸-丙氨酸(Ala-Ala)特征序列[21]。本实验所分离纯化的PVI、PVII、PVIII都拥有109个氨基酸,且氨基酸序列在相应位置为Ala-Ala,即可证明该3种PV亚型均为β型。
表2 PV氨基酸序列HPLC-MS/MS分析
Table 2 HPLC-MS/MS analysis of amino acid sequence of PV
PV亚型亚型编号平均分子质量/kDa氨基酸序列#序列匹配度/%PVIQ804W212.029 01MAMKNLLKDDDIKKALDQFK AADSFDHKKFFDVVGLKALSADNVKLVFKALDVDASGFIEEEELKFVLKG FSADGRDLTDKETKAFLAAADKDGDGKIGIDEFEALVHE10974PVIIQ6IMW711.581 01MAFAGVLNDADISAALEACKAADSFNHKSFFAKVGLASKSADEVKKAFAIIDQDKSGFIEEEELKLFLQNFKADARALTDGETKTFLKAGDSDGDGKIGIDEFAALVKA109100PVIIIQ9I8V011.622 01MAFAGILKDEDVAAALKDCAAADSFNYKNFFAKVGLSAKSPDDIKKAFFVIDQDKSGFIEEDELKLFLQNFSAGARALTDAETKAFLSAGDSDGDGKIGVDEFALLVKA10999
注:#下划线表示匹配肽段;上标数字代表氨基酸序号(下同)
由表2可知,在所匹配的PV氨基酸序列中,PVII和PVIII具有高度的同源性,氨基酸序列相似性为77%,其中有2处序列超过10个氨基酸的重合,分别为51~61(IDQDKSGFIEE)和89~99(AGDSDGDGKIG)。在51~61肽链中,与GUO等[22]报道的鲣鱼、沙丁鱼、鲭鱼的PV氨基酸残基相同,而在89~99肽链中的氨基酸残基则与鲤鱼、鳕鱼和鲹鱼PV亚型氨基酸残基相同。另外,MARINA等[23]确定鳕鱼含有3个线性表位,其中一个表位为:AGDSDGDGKI,与PVII和PVIII在89~98肽链中的氨基酸残基相同,故该位置可能为PVII和PVIII的抗原表位。
为了研究自制鲢鱼的PV亚型与已报道鲢鱼PV亚型的氨基酸序列差异,分别用PVII、PVIII所匹配的氨基酸序列与表3中已报道的鲢鱼PV亚型(gi 209902357和gi 209902355)氨基酸序列[20]进行比对分析,发现两者同亚型的氨基酸序列相似性较高,分别为89%和88%。结果说明,不同品种的鲢鱼PV亚型氨基酸序列存在高度同源性。另外,在比对的PV亚型序列中,均含有一个保守的半胱氨酸残基,为Cys-19。这个半胱氨酸的巯基有利于产生链间二硫键,形成二聚体,有利于提高PV亚型的稳定性[19]。
表3 PVII与PVIII氨基酸序列比较
Table 3 Comparison of amino acid sequences of PVII and PVIII
PV亚型亚型编号氨基酸序列相似性/%PVIIgi 2099023571MAFAGILNDA DIAAALEACK AADSFNHKAF FAKVGLSAKS GDDVKKAFAI IDQDKSGFIE EDELKLFLQN FKAGARALTD AETKIFLKAG DSDGDGKIGV DEFAALVKA10989PVIIIgi 2099023551MAFAGILNEA DVTAALQACQ AADSFKYKDF FAKVGLSAKS PDDIKKAFAV IDQDKSGFIE EDELKLFLQD FSAGARALTD AETKAFLKAG DSDGDGKIGV DEFAVLVKA10988
蛋白质具有特定的氨基酸序列,当其被酶水解后,产生的多肽氨基酸序列各不相同,因此由氨基酸残基构成的多肽具有一定特征性,可用于鉴定蛋白质。基于每种蛋白质具有其特定氨基酸序列的原理,利用质谱获得特征性多肽的序列信息可有效达到蛋白质鉴定目的。鲢鱼3种亚型特征肽段的二级质谱图如图4所示。由图4-a可知,质荷比m/z为426.882 23+,该多肽所对应的质量为1 277.625 1 Da,HCD模式产生的一系列b离子和y离子证明了多肽序列的正确性,通过De novo鉴定出PVI的最独特的肽段结构为 85AFLAAADKDGDGK97;由图4-b可知,m/z为960.486 52+对应的多肽质量为1 918.945 8 Da,所鉴定的特征肽段为2AFAGVLNDADI-SAALEACK20,HCD断裂多肽片段所产生的系列y离子(y1,y4~y5,y7,y10,y12~y14,y16)和b离子(b2~b5)证明了多肽序列的准确性;类似地,由图4-c可知,m/z为616.350 52+的多肽质量为1 202.691 0 Da,特征性多肽的质量与理论值匹配良好,误差为-2.6,同时也鉴定出了自制鲢鱼PVIII的特征肽段为98IGVDEFALLVK108。
肽段修饰一般有甲基化、酰基化、磷酸化、泛素化等类型[24-26],且HPLC-MS/MS可以准确地鉴定修饰位点的数量和位置。为了研究3种PV亚型的序列差异,对3种PV亚型肽段修饰情况进行鉴定,并分析其氨基酸序列的修饰情况,结果如表4所示。在PVI修饰肽段中,发现其只发生了酰基化,修饰位点为Ala-90、Asp-91;在PVII修饰肽段中,共有27个氨基酸被修饰,其中酰基化修饰最多,共有17个氨基酸,为Lys-28、33、39、97,Ala-47、89,Gln-53、69,Asp-54,Arg-77,Ser-56,Leu-66、87,Phe-67、71,Ile-98和Glu-102,而泛素化和磷酸化都只有2个氨基酸发生了修饰,泛素化修饰为Lys-55、72,而磷酸化则是Ser-13、38;类似地,在PVIII肽段中,与PVII修饰情况相同,有23个氨基酸发生了磷酸化、酰基化、甲基化和泛素化修饰,而修饰氨基酸数量却低于PVII氨基酸修饰数量。另外,通过2.4小节可知,89AGDSDGDGKI98可能为PVII和PVIII的抗原表位。PVII和PVIII在该表位区域都发生了酰基化修饰,同样地,PVII修饰氨基酸数量高于PVIII氨基酸修饰数量。结果表明,在自制的鲢鱼3种PV亚型中,除了PVI只存在酰基化修饰外,其余2个亚型都存在磷酸化、酰基化、甲基化和泛素化修饰,修饰位点的数量和位置对于PV亚型的免疫活性是否存在影响还有待深入研究。
a-PVI;b-PVII;c-PVIII
图4 PV亚型最独特的肽段鉴定
Fig.4 Identification of the most unique peptide of PV isotypes
表4 PV 3种亚型肽段修饰情况对比
Table 4 Comparison of modifications of PV isobtypes of peptides
亚型氨基酸序列修饰情况甲基化酰基化磷酸化泛素化PVI1MAMKNLLKDDDIKKALDQFKAADSFDHKKFFDVVGLKALSADNVKLVFKALDVDASGFIEEEELKFVLKGFSADGRDLTDKETKAFLAA∗A∗DKDGDGKIGI DEFEALVHE109--A90、D91----PVII1MAFAGVLNDADI∗SAALEACKAADSFNH∗KSFFA∗KVGLA∗S∗KSADEV∗K∗K∗AFAⅡ∗D∗Q∗D∗K∗SGFIEEEELK∗L∗FL∗QN∗F∗KADA∗RALTDGET∗KTF∗LK∗AGDSDGDG∗K∗IGI∗D∗EFAALV∗KA109K45~46、D52、K84、D101、K108K28、K33、K39、A47、Q53、D54、S56、L66、F67、Q69、F71、R77、L87、A89、K97、I98、E102S13、S38K55、K72PVIII1MAFAGILKDEDVAAALKDCAAADSFNYK∗NFFA∗K∗VGLSA∗K∗SPDDI∗KKAFFVIDQD∗K∗S∗G∗FIEEDEL∗K∗LFLQN∗FSA∗GAR∗ALTDA∗E∗T∗K∗AFL∗SAGDSDGDG∗K∗IGV DEFALLV∗KA109N29、K33、K55、E82、K84V34、K45、G57、F58、L66、F71、G74,A77、T83、A85、K97、I98、K108S56S40、K39、K65、S88
注:*表示该氨基酸发生修饰;数字代表修饰位点;--表示无修饰
本研究采用DTT、Tris和甘氨酸混合溶液提取鲢鱼肌肉中PV,经硫酸铵分级盐析、HPLC-SEC分离纯化,得到了鲢鱼PV的4个特征峰,并对其进行SDS-PAGE测定,同时采用电泳胶条酶解和高分辨质谱鉴定,得到3种PV亚型PVI、PVII、PVIII,其平均分子质量分别为12.029 0 kDa、11.581 0 kDa和11.622 0 kDa,氨基酸序列分别与PV亚型Q804W2,Q6IMW7和Q9I8V0的氨基酸序列匹配率为74%、100%和99%;PVII和PVIII氨基酸序列分别与已报道鲢鱼PV亚型gi 209902357和gi 209902355的氨基酸序列相似性为89%和88%。结果说明,不同品种的鲢鱼之间的PV亚型氨基酸序列存在高度同源性。此外,鉴定出PVI、PVII、PVIII的特征肽段分别为 85AFLAAADKDGDGK97、2AFAGVLNDADISAALEACK20、98IGVDEFALLVK108;PVII、PVIII主要存在磷酸化、酰基化、甲基化和泛素化修饰,且PVII修饰程度高于PVIII和PVI,修饰类型、数量和位置对于PV亚型的免疫活性可能存在影响。这些结果表明,本实验采用的方法可以快速分离纯化PV,同时鉴定出其亚型、氨基酸序列、蛋白修饰位点和数量,可为鱼类过敏原的研究提供数据参考。
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