动态pH值调控策略提高ε-聚赖氨酸发酵产量及其原因解析

邓玥1,2,柳天一1,2,陈旭升1,2*

1(工业生物技术教育部重点实验室(江南大学),江苏 无锡,214122) 2(江南大学 生物工程学院,江苏 无锡,214122)

摘 要 ε-聚赖氨酸(ε-poly-L-lysine,ε-PL)是一种通过微生物发酵法生产的同型氨基酸聚合物。为了提高Streptomyces albulus GS114的ε-PL发酵产量,建立了一种基于动态pH值调控溶氧水平的发酵策略,并从氧化损伤与抗氧化角度对该策略提高ε-PL发酵产量的原因进行了初步解析。研究发现,在发酵中后期通过调节pH值来控制溶氧水平保持在20%~40%,实现了菌体干重达到62.03 g/L,ε-PL产量达到60.2 g/L,分别比未调控提高了59%和36%。对S.albulus GS114胞内氧化损伤和抗氧化能力进行分析发现,采用该调控策略一方面增加了菌体胞内活性氧水平,另一方面也增强了菌体的总抗氧化能力。不同pH发酵过程的菌体胞内活性氧水平、氧化损伤程度和总抗氧化能力分析发现,菌体生长、活性氧水平、氧化损伤程度和总抗氧化能力均与pH值呈正相关。因此,动态调节pH值策略显著增强菌体生长的同时,带来了菌体胞内活性氧水平、氧化损伤程度和总抗氧化能力的提高,但菌体的总抗氧化能力实现了活性氧水平和氧化损伤维持在适当水平,进而促进了ε-PL在发酵中后期的生物合成。该研究不仅对提升工业发酵ε-PL水平具有实际指导意义,且初步发现了活性氧对促进ε-PL生物合成的潜在作用。

关键词 ε-聚赖氨酸;发酵策略;pH;活性氧;总抗氧化能力

ε-聚赖氨酸(ε-poly-L-lysine,ε-PL)是一种由25~35个L-赖氨酸单体,在ε-PL合成酶催化下通过ε-氨基和α-羧基脱水缩合连接而成的同型氨基酸聚合物[1],具有广谱的抑菌活性和优良应用属性,现已被多个国家批准作为生物防腐剂在食品、化妆品防腐等领域应用[2-4]。近年来,在医药、生物制药和农业等行业中也显示出应用潜力[5-7]。因此,ε-PL具有广阔的市场应用前景。

微生物发酵法是目前工业生产ε-PL的唯一方式,提升发酵水平以降低其生产成本是实现ε-PL广泛应用的重要前提。因此,研究者们试图通过菌株选育和发酵过程优化来提高生产菌的ε-PL发酵产量。相比于菌株选育,发酵过程优化与调控是一种简单、快速提高产物发酵水平的有效手段。在ε-PL发酵优化和调控研究方面,KAHAR等[8]建立了两阶段pH值控制策略,结合葡萄糖和硫酸铵流加工艺,实现Streptomyces albulus S410的ε-PL产量达到48.3 g/L,长期处于国际领先水平。ZHANG等[9]采用丝瓜囊作为细胞固定化载体,建立了搅拌式发酵罐Kitasatospora sp.MY 5-36重复批次发酵工艺,ε-PL平均产量达到34.11 g/L,固定化细胞重复利用5次,发酵周期达到526 h。LIU等[10]利用弱酸性阳离子树脂D152进行ε-PL原位产物分离发酵的尝试,在5 L发酵罐中进行192 h补料分批发酵,ε-PL质量浓度达到23.4 g/L,较游离菌体发酵ε-PL产量提高了6.2倍。作者所在实验室提出了一种pH冲击发酵策略,经过192 h补料分批发酵,可实现S.albulus M-Z18发酵甘油和葡萄糖生产ε-PL的产量分别达到54.7和47.13 g/L[11-12],帮助我国ε-PL发酵产量迈入国际先进行列。由此可见,通过优化菌体发酵方式和调控pH值能够有效提升ε-PL发酵水平。

前期,本实验室通过长期的菌株选育,获得了1株ε-PL高产突变株S.albulus GS114,其摇瓶ε-PL产量较出发菌株S.albulus M-Z18提高了70%左右。然而,采用已有的培养条件和发酵控制策略,S.albulus GS114的ε-PL产量较出发菌株仅能提高13%左右[13]。如何建立针对性的发酵调控策略是发挥高产菌株生产潜能的关键。因此,本文通过调节pH值的方式来调控发酵中后期溶氧水平,以期提高S.albulus GS114的ε-PL发酵产量,并从氧化损伤角度,初步解析该策略提高ε-PL发酵产量的原因。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株

Streptomyces albulus GS114,实验室选育和保藏。

1.1.2 培养基

固体培养基(BTN)(g/L):葡萄糖10,酵母粉1,鱼粉蛋白胨2,pH 7.5。

种子培养基(g/L):葡萄糖30,酵母粉8,(NH4)2SO4 5,KH2PO4 1.36,MgSO4·7H2O 0.5,ZnSO4·7H2O 0.04,FeSO4·7H2O 0.03,pH 7.5。

发酵培养基(g/L):葡萄糖90,酵母粉8,(NH4)2SO4 5,KH2PO4 1.36,MgSO4·7H2O 0.5,ZnSO4·7H2O 0.04,FeSO4·7H2O 0.03,pH 6.8。

1.1.3 试剂和仪器

葡萄糖,优级纯,山东西王药业有限公司;酵母粉,Oxide公司;其他试剂分析纯,国药化学试剂有限公司;过氧化氢酶(catalase,CAT)检测试剂盒,南京建成生物工程研究所;超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)检测试剂盒、总抗氧化能力(total antioxidant capacity,T-AOC)检测试剂盒,苏州科铭生物技术有限公司。

5 L发酵罐,上海保兴生物设备有限公司;T&J-Miniskid 1 L*4迷你平行生物反应器,迪比尔生物工程(上海)有限公司;UV-2100分光光度计,优尼科仪器有限公司;AB204-N分析天平,瑞士梅特勒公司;恒温培养箱GNP-9160,上海光都仪器设备有限公司;3K15高速冷冻离心机,德国西格玛公司;Enspire多标记检测系统(酶标仪),珀金埃尔默有限公司;biotek多功能酶标仪,美国伯腾仪器有限公司。

1.2 实验方法

1.2.1 培养方法

种子培养:挑取2~3环孢子接种至种子培养基,30 ℃、200 r/min培养24 h。

5 L发酵罐补料分批发酵:在5 L发酵罐中装入3.2 L发酵培养基,发酵开始前将初始pH调至6.8,温度设定为30 ℃,转速为200 r/min,通气量1 vvm。然后按照8%的接种量将280 mL种子液接入。接种后pH自然下降,当pH降至5.5时,通过流加氨水维持pH预培养10 h。随后不控制pH使其自然下降,降至4.0开始计时,5 h后将pH调至4.0。对照组中,维持pH 4.0直至发酵结束;pH调控组中,根据溶氧变化调节pH,使其维持在20%~40%。当发酵液中葡萄糖质量浓度<10 g/L时,根据葡萄糖的消耗速率设定补料速率,补加质量浓度为750 g/L葡萄糖溶液,维持发酵液中葡萄糖质量浓度在10 g/L左右直至发酵结束。与此同时,当质量浓度低于0.2 g/L时脉冲补加375 g/L(NH4)2SO4溶液,使质量浓度维持在0.2~0.5 g/L,如此重复直至发酵结束。

不同pH条件的分批发酵:将培养好的种子液以体积分数8%接种量接入,装液量为600 mL,温度设置为30 ℃,初始转速为200 r/min,溶氧设置为30%,转速溶氧联动控制。待pH分别自然下降至3.5、4.0、4.5和5.0时,用体积分数12.5%的NH3·H2O分别维持pH恒定直至发酵结束。

1.2.2 分析方法

发酵过程参数测定:葡萄糖浓度使用生物传感分析仪(SBA-40C)进行测定,样品稀释100倍,25 μL进样量进行测定;浓度采用奈斯勒试剂比色法[14]测定;ε-PL浓度采用甲基橙比色法[15];菌体干重(dry cell weight,DCW)测定参考汪泽等[16]的方法。

活性氧(reactive oxygen species,ROS)测定:采用荧光探针2,7-二氯荧光双乙酸盐(2,7-dichlorofluorescent diacetate,DCFH-DA)测定,方法为:取80 μL发酵液置于1.5 mL离心管中,加入920 mL磷酸缓冲液进行稀释悬浮后,再加入浓度为10 mmol/L的DCFH-DA 1 μL,充分混匀后置于30 ℃,200 r/min摇床中,反应40 min。12 000 r/min离心5 min,弃上清液,收集菌体,加入磷酸缓冲液12 000 r/min离心5 min洗涤4次,弃上清液,再加800 μL磷酸缓冲液重悬菌体,吸取200 μL于酶标孔中,在502、530 nm下检测荧光强度,并通过蛋白浓度将其定量。根据荧光强度的大小即可反映胞内ROS的水平。

氧化损伤指标测定:丙二醛(malonaldehyde,MDA)含量参考ZENG等[17]的方法。

羰基含量测定参考段丽菊等[18]的方法。

抗氧化体系测定:SOD、CAT和T-AOC按照试剂盒说明进行操作。

2 结果与讨论

2.1 基于动态pH值调控溶氧水平策略发酵生产ε-PL的过程参数分析

低pH值冲击工艺是本实验室在优化S.albulus M-Z18发酵生产ε-PL时,建立的一种高效发酵生产ε-PL的控制策略。将该调控策略用于S.albulus GS114发酵生产ε-PL时(图1-a),可实现ε-PL产量达到44.1 g/L,菌体量为38.99 g/L。相比于S.albulus M-Z18发酵结果,ε-PL产量提高了16%,但菌体量却下降了24.4%,显示出S.albulus GS114具有较高的单位菌体ε-PL合成能力。S.albulus GS114是经过基因组重排和核糖体工程连续选育,获得的1株高产ε-PL突变株,其摇瓶ε-PL产量达到3.0 g/L,较出发菌S.albulus M-Z18提高了1.7倍。然而,S.albulus GS114作为二代菌株,在5 L发酵罐中ε-PL发酵产量仅较一代菌株S.albulus M-Z18提高了10%左右,显示出S.albulus GS114仍有产量提升空间。如图1-a所示,利用低pH冲击工艺,可以实现S.albulus GS114产量达到44.1 g/L,菌体量为(38.99±3.83)g/L。另外,从发酵过程溶氧变化趋势来看,从36 h开始溶氧水平逐渐上升,到96 h时溶氧水平达到70%并一直维持至发酵结束,意味着在发酵过程中S.albulus GS114出现了明显菌体活力下降。因此,我们试图通过提升菌体活力达到增加菌体量的目的,以进一步提高ε-PL产量。

为此,本研究通过发酵中后期动态调节pH值来控制发酵过程溶氧水平保持在20%~40%,从而建立了一种基于动态pH值调节溶氧水平的发酵控制策略,发酵过程参数如图1-b所示。采用动态pH值调节溶氧水平的发酵控制策略,在48 h时适当提高pH值,随后溶氧在60 h左右开始下降;当溶氧水平低于20%时,再适当下调pH值,如此反复,实现发酵过程溶氧水平维持在20%~40%。经过192 h补料分批发酵,DCW达到62.03 g/L,ε-PL产量达到(60.2±0.94)g/L,分别比未调控提高了59%和36%。由此可见,基于动态pH值调节溶氧水平的发酵控制策略,不仅能够显著改善S.albulus GS114生长状况,而且能够明显提高其ε-PL发酵产量,实现二代菌株S.albulus GS114发酵产量的进一步提高,对提升工业发酵ε-PL水平具有重要指导意义。

a-pH冲击策略;b-pH调控策略
图1 不同策略发酵过程中各指标变化
Fig.1 Indices under different strategies during fermentation

2.2 动态pH值调控溶氧水平发酵生产ε-PL过程的氧化损伤相关参数分析

2.2.1 ROS水平及氧化损伤分析

ROS,包括和·OH,是细胞在有氧条件下进行能量代谢产生的一类具有氧化活性的分子总称[19-20]。为了探讨动态pH值调控溶氧策略提高ε-PL发酵产量的原因,本研究首先对发酵过程中的ROS进行了检测。如图2-a所示,不管对溶氧是否进行调控,ROS水平整体上均呈现先上升后下降的趋势。然而,基于动态pH值调节溶氧水平的发酵(pH调控组),从72 h开始ROS水平显著高于pH冲击组,并在144 h达到最大值,随后开始下降。

a-ROS;b-MDA;c-羰基含量
图2 发酵过程中的氧化损伤参数比较
Fig.2 Comparison of oxidation damage parameters during fermentation

分别以脂质氧化产物MDA(图2-b)和蛋白质氧化产物羰基(图2-c)的含量作为氧化损伤指标来评估ROS对菌体带来的氧化损伤。如图2-b所示,MDA含量随着发酵进行而逐渐上升,在整个发酵过程中pH调控组始终略高于pH冲击组,这也符合高ROS水平会给菌体带来更高氧化损伤的一般认知。然而,如图2-c所示,2组的羰基含量几乎处于同一水平,直到发酵结束时才出现差异。这可能因为小白链霉菌的呼吸链位于细胞膜上,呼吸作用产生的ROS首先对膜脂质进行攻击,同时膜脂质的氧化增加了电子泄露的可能[21],导致更高的ROS水平。

以上结果说明,随着发酵的进行S.albulus GS114受到的氧化损伤程度逐渐增加,但是更高的ROS水平并未带来更高的氧化损伤。这可能是因为通过pH调控策略使得菌体的活力增强,即使在ROS水平较高的情况下也能够通过激活抗氧化系统来保护自身免受氧化胁迫的危害。

2.2.2 抗氧化能力分析

为进一步评估菌体抗氧化能力,本研究分析了发酵过程中菌体的CAT、SOD的活性以及T-AOC。SOD能够催化歧化生成O2和H2O2,而CAT则将H2O2分解为H2O和O2。如图3-a所示,pH冲击组的CAT活力在72 h时达到了最大值,之后开始下降并维持在很低水平;而pH调控组的CAT活力从72 h开始显著高于pH冲击组,这可能是因为在此期间ROS水平较高引起的(图2-a)。意外的是,图3-b显示pH冲击组的SOD活力却始终高于pH调控组,且在120 h前两者差异不明显,但在120 h后pH冲击组显著高于pH调控组。另外,2组的SOD活力在发酵后期均逐渐上升,这与ROS水平在发酵后期稳定下降相吻合(图2-a),表明SOD在发酵后期清除ROS的过程中可能起着关键作用。菌体的T-AOC检测发现,如图3-c所示,2组T-AOC变化趋势保持高度一致性,均在96 h达到最大值后逐渐趋于平稳,但是pH调控组的T-AOC始终显著高于pH冲击组,这说明pH调控使得S.albulus GS114活力增强的同时,其抗氧化能力也得到了提高,从而使菌体即使在较高的ROS水平下也能进行正常生长和代谢。

a-CAT;b-SOD;c-T-AOC
图3 发酵过程中抗氧化能力参数比较
Fig.3 Comparison of antioxidant capacity parameters during fermentation

2.3 pH值对ε-PL发酵过程中氧化损伤相关参数影响的分析

为了探究动态pH值调控溶氧发酵过程中,ROS水平升高和菌体抗氧化能力提高的原因,本研究分别考察了S.albulus GS114在pH 3.5、4.0、4.5和5.0的ROS水平和菌体T-AOC。如图4-a所示,pH值越高DCW越大,在pH 5.0发酵条件下,菌体生长情况最好;而在pH 3.5时,DCW在36 h达到最大之后开始逐渐下降,表明S.albulus GS114在此pH值下不适宜生长。图4-b显示的是不同pH值下菌体细胞内的ROS水平。pH值越高,ROS水平越高,除pH 3.5外,ROS在12~24 h激增,在24~48 h波动不大,48 h后迅速增加,整体上呈现先上升后稳定再上升的趋势。这可能是由于在较高的pH下,菌体生长状态较好,其呼吸活力较强,产生的ROS水平就越高,这个结果与pH调控组的ROS水平较高相吻合(图3-a)。图4-c显示的是对不同pH下S.albulus GS114胞内的总抗氧化能力进行了比较。菌体总抗氧化能力与发酵pH值高地成正比,pH 3.5时抗氧化能力明显低于其他3组,这也与其菌体生长情况相吻合,表明较低的pH不仅抑制了S.albulus GS114的正常生长,也抑制了其胞内各种代谢的正常进行。通过考察不同pH条件下S.albulus GS114的ROS水平和T-AOC发现,pH值越高ROS水平越高,在pH 4.0与4.5时,随着发酵时间的增加,ROS水平的差异逐渐增大,由于pH调控策略在发酵过程中有较长的一段时间需要将pH提升至4.0以上,因此在pH调控的发酵过程中ROS一直处于较高的水平;菌体的总抗氧化能力也与发酵pH值成正比,这可能是由于pH越高,S.albulus GS114生长状态越好,呼吸活力的增强带来了更多的ROS,从而激活胞内的抗氧化系统,使得自身的总抗氧化能力得到增强。

a-DCW;b-ROS;c-T-AOC
图4 不同pH发酵的菌体量、ROS水平和抗氧化能力比较
Fig.4 Comparison of biomass,ROS level and T-AOC during fermentation with different pH

3 结论

为了提高S.albulus GS114的ε-PL发酵产量,本文通过在发酵中后期动态调节pH值来控制发酵过程溶氧水平在20%~40%,建立了一种基于动态pH值调节溶氧水平的发酵控制策略,ε-PL产量达到(60.2±0.94)g/L,较未调控发酵提高了36%。通过氧化损伤相关参数分析,初步揭示了动态pH值调节溶氧水平提高ε-PL发酵产量的原因:动态调节pH值策略显著增强了发酵中后期菌体生长能力和总抗氧化能力(包括过氧化氢酶活性),以维持菌体胞内ROS产生水平维持在菌体可以承受的范围,促进了ε-PL在发酵中后期的生物合成。很多研究都已表明ROS具有调节次级代谢产物的作用[22-24],本研究结果初步发现了ROS对促进ε-PL生物合成的潜在作用,因此下一步将考察ROS是否直接调节聚赖氨酸的合成,为提升工业发酵ε-PL水平提出进一步指导。

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Improvement of ε-poly-L-lysine production based on dynamic pH regulation and its mechanism analysis

DENG Yue1,2,LIU Tianyi1,2,CHEN Xusheng1,2*

1(The Key Laboratory of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan University,Wuxi 214122,China) 2(School of Biotechnology,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)

Abstract ε-Poly-L-lysine (ε-PL) is a homopoly(amino acid) produced by microbial fermentation. In order to improve the production of ε-PL of Streptomyces albulus GS114, a fermentation strategy based on dynamic pH value to regulate the level of dissolved oxygen was established, oxidative damage and antioxidation were used to explore the reasons of improved ε-PL production. The dry cell weight of S. albulus GS114 reached 62.03 g/L and the production of ε-PL reached 60.2 g/L, which were 59% and 36% higher than that without regulation, respectively, through the controlling of dissolved oxygen level at 20%-40% by adjusting pH value in the middle and late stages of fermentation. By analyzing the intracellular oxidative damage and antioxidation of S. albulus GS114, it was found that the developed strategy not only increased the level of intracellular reactive oxygen species, but also enhanced the total antioxidation capacity. Moreover, the cell growth, reactive oxygen species level, oxidative damage and total antioxidation capacity were positively correlated with pH values. As a result, the developed strategy significantly enhanced the cell growth, while the level of intracellular reactive oxygen species, oxidative damage and the total antioxidation capacity were also improved. However, the total antioxidation capacity of the bacteria kept the level of reactive oxygen species and oxidative damage at an appropriate level, and thus promoted the biosynthesis of ε-PL in the middle and late stages of fermentation. The study not only provides a strategy for improving the ε-PL production of industrial fermentation, but also finds the potential role of reactive oxygen species in promoting the biosynthesis of ε-PL.

Key words ε-poly-L-lysine; fermentation strategy; pH; ROS; total antioxidant capacity

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.027200

引用格式:邓玥,柳天一,陈旭升.动态pH值调控策略提高ε-聚赖氨酸发酵产量及其原因解析[J].食品与发酵工业,2021,47(23):24-29.DENG Yue,LIU Tianyi,CHEN Xusheng.Improvement of ε-poly-L-lysine production based on dynamic pH regulation and its mechanism analysis[J].Food and Fermentation Industries,2021,47(23):24-29.

第一作者:硕士研究生(陈旭升副教授为通讯作者,E-mail: chenxs@jiangnan.edu.cn)

基金项目:江苏省自然科学基金项目(BK20191332);国家自然科学基金项目(31671846)

收稿日期:2021-03-03,改回日期:2021-04-01