pH-DO组合调控策略提高小白链霉菌ε-聚赖氨酸的生物合成

吴梦萍1,2,王靓1,2,张建华1,2,张宏建1,2,陈旭升1,2*

1(江南大学,生物工程学院,江苏 无锡,214122)2(工业生物技术教育部重点实验室(江南大学),江苏 无锡,214122)

摘 要 ε-聚赖氨酸(ε-poly-L-lysine,ε-PL)是一种主要由小白链霉菌生产的广谱性天然食品防腐剂,具有广泛的工业应用价值。该研究对ε-PL高产菌Streptomyces albulus WG-608在5 L罐发酵不同阶段的pH与溶解氧(dissolved oxygen,DO)进行了系统优化,并构建了一种新的pH-DO组合调控策略。该策略将发酵分为2个阶段:第一阶段DO被控制在40%,pH维持在4.0;第二阶段DO被控制在20%,pH维持在4.3。经240 h的补料-分批发酵,WG-608的ε-PL产量与平均比生产速率为(68.77±2.53) g/L和(2.33±0.08) d-1,比对照策略分别提高了28.23%和12.02%。为进一步探究该策略提高WG-608 ε-PL产量的细胞生理代谢差异的原因,对不同时期细胞的关键酶活力、呼吸链活力和辅因子水平等进行了分析。结果表明,葡萄糖消耗、中心碳代谢途径、L-赖氨酸生物合成途径、呼吸链活性和胞内辅因子的增强是pH-DO组合调控策略增强ε-PL产量的原因。总之,pH-DO组合调控策略是一种通过增强碳代谢和能量代谢提高ε-PL产量的有效方法。该方法的建立为其他链霉菌发酵生产ε-PL提供了新的思路。

关键词 ε-聚赖氨酸;小白链霉菌;食品防腐剂;pH;溶解氧

ε-聚赖氨酸(ε-poly-L-lysine,ε-PL)是一种天然均聚氨基酸,由25~35个L-赖氨酸(L-lysine, L-lys)单体通过α-COOH和ε-NH2脱水缩合而成[1]。作为一种广谱的阳离子抗菌肽,ε-PL可以破坏革兰氏阳性/阴性细菌、酵母菌等真菌的细胞包膜结构,从而抑制微生物的生长。目前,ε-PL已被日本、韩国、美国和中国等国家批准作为食品防腐剂。此外,ε-PL具有良好的水溶性、对环境与人类无公害以及可生物降解性等极具商业价值的特性,因此被广泛应用于食疗剂、干扰剂、酶保护剂、药物载体等领域[2]。然而,作为一种主要由链霉菌生产的次级代谢产物,ε-PL产量较低,限制了其工业化生产及商业应用。

pH和溶解氧(dissolved oxygen, DO)是影响ε-PL发酵最主要的限制因素。一般来说,pH可以通过改变细胞膜的表面电荷来影响营养物质的有效性和酶活性,从而影响细胞活力[3]。KAHAR等[4]发现ε-PL产生的最适pH为4.0,而pH>5对细菌菌丝生长更有利。基于此,该团队建立了两阶段pH调控策略,将产量从5.7 g/L提高到48.3 g/L,提高了7.47倍。REN等[5]发现短时的酸性pH冲击可以促进菌体快速地生长及ε-PL的大量合成,随后建立了pH冲击工艺,将ε-PL产量提高了52.5%,达到54.70 g/L。此外,由于ε-PL发酵为好氧发酵且发酵液的黏度较高,限制了DO在扩大发酵时的传递效率。为了解决这个问题,XU等[6]在补料分批发酵过程中,外源添加了氧载体(0.5%正十二烷),提高了发酵液中DO浓度,将产量提高了31.6%。随后,该团队通过过表达透明颤菌的血红蛋白基因(vgb),提高了Streptomyces albulus PD-1发酵的氧气摄取能力,将ε-PL提高至34.2 g/L,增加了50%[7]。然而,以往研究主要集中在ε-PL发酵前期(前36 h)对pH和DO的单独优化,很少有策略对pH与DO进行同时优化。

在前期的工作中,本团队经过多轮诱变与核糖体工程选育,筛选出一株高产菌Streptomyces albulus WG-608,其摇瓶ε-PL产量较出发菌提高了42.3%[8]。该菌株在发酵进入稳定期后,出现了葡萄糖消耗速度大幅下降、菌体生长受到明显抑制的现象,进而影响了ε-PL的单位菌体合成能力。基于此,本研究开发了一种新的pH-DO组合调控策略,分阶段对pH和DO进行系统优化,显著提高了WG-608的单位菌体合成能力与ε-PL产量。随后,研究了WG-608的细胞生理变化,包括关键酶活性、呼吸链活性和胞内核苷酸水平,以阐明pH-DO组合调控策略对细胞代谢的影响。

1 材料与方法

1.1 实验材料

1.1.1 菌种

Streptomyces albulus WG-608由出发菌S.albulus M-Z18经多轮诱变及核糖体工程获得,并由本实验室保藏[9]

1.1.2 培养基与溶液

种子发酵培养基(g/L):葡萄糖40,酵母粉8,(NH4)2SO4 5,K2HPO4 2,MgSO4·7H2O 0.5,FeSO4·7H2O 0.03,ZnSO4·7H2O 0.04,用NaOH调pH至7.2。

发酵培养基(g/L):葡萄糖60,酵母粉8,(NH4)2SO4 5,K2HPO4 2,MgSO4·7H2O 0.5,FeSO4·7H2O 0.03,ZnSO4·7H2O 0.04,消泡剂0.2,pH 6.8。

流加培养基(g/L):葡萄糖750,氨水12.5%(体积分数,下同),(NH4)2SO4 375,消泡剂100。

100 mmol/L Tris-HCl:2.4228 g Tris和0.0308 g二硫苏糖醇(dithiothreitol, DTT, 1 mmol/L)溶于20%甘油并定容至200 mL,再用浓HCl调pH至7.5。

1.1.3 主要试剂与仪器

葡萄糖(优级纯),山东西王药业有限公司;酵母粉,Oxoid公司;其他试剂,均为分析纯,国药化学试剂有限公司;ATP、NAD(P)H试剂盒,上海碧云天生物技术有限公司;碘硝基氯化四氮唑蓝(iodonitrotetrazolium chloride, INT),上海源叶生物科技有限公司;BCA蛋白测定试剂盒,宝日医生物技术(北京)有限公司。

5 L发酵罐,上海保兴生物设备有限公司;UV-2100分光光度计,优尼科仪器有限公司;AB204-N分析天平,瑞士梅特勒公司;GNP-9160恒温培养箱,上海光都仪器设备有限公司;3K15高速冷冻离心机,德国Sigma公司;HYL-C组合式摇床,太仓市强乐设备有限公司;SW-CJ-1FD超净工作台,苏州安泰空气技术有限公司;SM-650D超声破碎仪,南京舜玛仪器设备有限公司;Biotek多功能酶标仪,美国伯腾仪器有限公司。

1.2 实验方法

1.2.1 培养条件

一级种子液培养,取孢子接种于种子培养基,置于30 ℃,200 r/min摇床培养24 h。

二级种子液培养,将6.4 mL种子液接入含80 mL种子培养基的500 mL锥形瓶中,30 ℃,200 r/min培养24 h。

5 L发酵罐ε-PL恒定pH补料分批发酵,在5 L罐中装入3.2 L发酵培养基灭菌,设置发酵罐温度30 ℃,初始转速200 r/min,曝气率1.14 vvm,pH 6.8,共发酵240 h。接种240 mL种子液入发酵罐,随着发酵的进行,发酵pH自然下降,当pH降至4.0时,补加12.5%的氨水溶液将pH控制在4.0,直至发酵结束。通过调整转速和通气量,使DO尽量维持在30%,当发酵液葡萄糖浓度<10 g/L时,根据葡萄糖的消耗速率设定补料速率,补加的葡萄糖溶液质量浓度为750 g/L。当罐内的NH4+-N质量浓度低于0.2 g/L时,补加375 g/L的(NH4)2SO4溶液,使其维持在0.1~0.5 g/L,直至发酵结束。

1.2.2 分析方法

1.2.2.1 发酵过程参数测定方法

葡萄糖浓度测定方法:将发酵液样品离心后取一定量的上清液,使用生物传感分析仪(biosensor analyzer,SBA)缓冲液稀释100倍,充分混匀后进行检测并读数;NH4+-N浓度测定方法:取发酵液离心后的上清液,稀释一定比例后,通过靛酚蓝反应法测定[9]。发酵液的ε-PL浓度由甲基橙比色法测定[10];菌体干重(dry cell weight, DCW)由滤纸差量法测定[11]

1.2.2.2 生理参数测量

粗酶液的制备参照王靓[12]的方法加以改进:取发酵液1 000×g离心5 min,弃上清液;0.2 g/L KCl溶液洗涤3次,弃上清液重悬于100 mmol/L Tris-HCl(pH 7.5)缓冲液;超声破碎仪在60%功率下破碎细胞20 min(工作2 s,停2 s),12 000×g离心20 min,上清液即为粗酶液,蛋白浓度测定参照BCA蛋白测定试剂盒。

酶活力测定方法:(1)葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase, G6PDH)活性测定参照TANG等[13]的方法并加以改进,100 mmol/L Tris-HCl缓冲液350 μL,0.4 mmol/L NADP+ 18 μL,5 mmol/L葡萄糖-6-磷酸7 μL,粗酶液50 μL;定义1U为30 ℃条件下每分钟1 μmol/L NADP+转化为NADPH所需的酶量。(2)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)活性测定参照BRAMWELL等[14]的方法并加以改进,100 mmol/L Tris-HCl缓冲液235 μL,1 mmol/L乙酰CoA 25 μL,40 mmol/L MnSO4 50 μL,100 mmol/L NaHCO350 μL,1.5 mmol/L NADH 50 μL,20 mmol/L磷酸烯醇式丙酮酸20 μL,500 U/mL苹果酸脱氢酶10 μL,粗酶液10 μL,定义30 ℃条件下反应1 min催化生成1 μmol NAD+所需的酶量为1个酶活力单位;(3)柠檬酸合酶(citrate synthase, CS)活力参照MURAKAMI等[15]的方法, 100 mmol/L Tris-HCl缓冲液235 μL,6.7 mmol/L 5,5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)[5,5′-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid), DTNB] 10 μL,200 mmol/L草酰乙酸二钠5 μL,1 mmol/L乙酰CoA 25 μL,定义30 ℃条件下反应1 min催化生成1 μmol柠檬酸-CoA所需的酶量为1个酶活力单位;(4)天冬氨酸激酶(aspartokinase, AK)活力参照曾昕[17]的方法,3 mol/L pH 7.0盐酸羟胺-KOH 50 μL,100 mmol/L ATP 50 μL,100 mmol/L MgSO4 50 μL,3 mol/L (NH4)2SO4 100 μL,50 mmol/L天冬氨酸-KOH 40 μL,粗酶液50 μL。定义30 ℃条件下反应1 min催化生成1 μmol天冬氨酰-β-羟肟所需的酶量为1个酶活单位;(5)PLS活性参考YAMANAKA等[16]的方法,100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)400 μL,100 mmol/L L-lys 100 μL,50 mmol/L ATP 100 μL,50 mmol/L MgCl2溶液100 μL,50 mmol/L DTT 100 μL,粗酶液200 μL,酶活定义为30 ℃条件下1 s催化减少1 pmol L-lys所需的酶量。

电子传递链的测量方法参照曾昕[17]的方法,在30 ℃条件下反应,100 mmol/L pH 7.5 Tris-HCl缓冲液60 μL,0.835 mmol/L NADH 15 μL,0.24 mmol/L NADPH 15 μL,0.133 mol/L丁二酸钠 30 μL,1 g/L曲拉通30 μL,4 mmol/L INT 30 μL,粗酶液50 μL,测定490 nm处吸光度。细胞电子传递活性按公式(1)计算:

(1)

式中:φ,细胞电子传递链活性,μL O2/(h·g蛋白);系数60可将反应时间分钟换算成小时;ΔA490,反应时间内的吸光度变化值;V,反应体系总体积,μL;1.42,INT接受O2电子比例;Δt,反应时间,min;V,酶液加入量,μL;H,反应体系的光径,nm。

ATP和辅因子测量:分别按照ATP检测试剂盒、NADPH检测试剂盒和NADH检测试剂盒进行检测。

1.2.3 数据分析

实验重复2~3次,结果表示为平均值±标准差。采用GraphPad prism 8.0对实验数据进行统计学分析,数据间的比较分析采用无交互作用的双因数方差分析(Two-way ANOVA)中的Bonferroni’s检验,显著性水平设定为0.05;作图采用OriginPro 9.1软件。

2 结果与讨论

2.1 S.albulus WG-608在恒定pH策略下的5 L罐发酵

在之前的研究中,经多级诱变、基因组改组及核糖体工程育种获得1株WG-608,其摇瓶的产量达到3.7 g/L,较出发菌M-Z18提高了48%[18]。在5 L罐中对WG-608进行了恒定pH 4.0补料-分批发酵,并研究其发酵特性。

如图1-a,pH在发酵10 h后快速下降,在24 h前降至pH 4.0,并维持至发酵结束。接种后DO快速下降,当其降至30%左右,通过调节转速和通气量将其维持在30%左右。

a-ε-PL发酵过程情况;b-ε-PL日增长量、 菌体日增长量和葡萄糖日消耗量
图1 恒定pH补料-分批发酵
Fig.1 Constant pH fed-batch fermentation

在整个发酵过程中,葡萄糖的质量浓度维持在1~10 g/L,以避免底物抑制。观察到葡萄糖的消耗速度在0~72 h快速增加,而72 h后开始显著下降。与之对应,菌体干重在前72 h内达到了39.57 g/L,而在72~240 h之间仅增长了9.59 g/L(图1-b)。ε-PL在整个发酵过程中持续快速积累,这意味着ε-PL属于生长半耦联型产物,其产量既受菌体的生长影响,还与菌体质量浓度相关。经240 h的补料分批发酵,ε-PL达到(53.63±0.78) g/L。

以上结果表明,发酵后期(72 h后)WG-608的底物葡萄糖消耗与菌株生长均受到了强烈抑制。发现ε-PL的合成受pH 和DO的影响十分显著,故将发酵过程划分为2个阶段,即菌体生长期(0~72 h)和产物合成期(72~240 h)。通过对pH和DO的系统优化,探索每个发酵阶段最适合的发酵条件,以期进一步提高WG-608的ε-PL合成能力。

2.2 pH对S.albulus WG-608发酵ε-PL的影响

研究表明,ε-PL仅在酸性培养条件下大量积累[16],但pH过低会抑制菌体的生长[19]。为了确定pH对高产菌WG-608生产ε-PL的影响,将pH分别控制在3.7、4.0、4.3和4.6,于5 L发酵罐内进行了72 h的补料分批发酵。如表1所示,pH值对菌体干重和ε-PL产量有显著影响。随着pH值的增加,菌体量逐渐增加,与KAHAR等[4]的结果类似。当pH为4.0时,ε-PL的产量达到最大值16.65 g/L,分别比pH 3.7,4.3和4.6提高了11.1%、10.9%、33.4%。此外,较低(3.7)或较高的pH(4.6)均不利于ε-PL的生产。这可能是由于当pH维持在3.7发酵时,细胞生长受到抑制(平均比生长速率最低),进而限制了ε-PL的合成。pH 4.6时,底物的消耗主要用于菌体的快速积累,此时ε-PL的产量和单位菌体合成能力最低,分别为12.48 g/L和0.57 g/g。

表1 不同pH条件下WG-608生产ε-PL的情况
Table 1 Comparison of ε-PL production by S.albulus WG-608 under different pH levels

发酵参数pH3.744.34.6DCW/(g·L-1)31.34±0.26∗∗38.83±0.3040.93±0.31∗∗41.79±0.32∗∗产量/(g·L-1)14.98±0.18∗∗16.65±0.1915.01±0.18∗∗12.48±0.1∗∗单位菌体合成能力/(g·g-1)0.478±0.0020.429±0.0020.367±0.0020.302±0.007平均比生长速率/d-11.714±0.0021.776±0.0021.777±0.0021.781±0.003平均比生产速率/d-10.89±0.010.81±0.010.69±0.010.57±0.01

注: *表示0.01<P<0.05,显著差异;**表示P<0.01,极显著差异,n=2~3,下同

在ε-PL发酵中,pH 4.0有利于胞内大量积累ATP,进而激活ε-PL合成酶的表达及调节其催化功能[16, 20]。然而,长时间的酸性环境导致ATP被大量消耗用以维持细胞稳态,不利于菌丝体的生长,继而影响ε-PL的合成[4, 21]。本研究发现虽然WG-608在pH 4.0时ε-PL浓度达到最大值,但其实pH 4.0与4.3条件下的菌体量、产量和单位菌体合成能力相差不大(表1)。鉴于pH 4.3时菌株表现出更强的菌体生长能力,因此选择在72 h后(发酵稳定期)将pH维持在4.3,以缓解酸性环境对菌体生长和ε-PL合成造成的不利影响[12]

2.3 DO对ε-PL补料分批发酵的影响

小白链霉菌发酵生产ε-PL属于好氧发酵,发酵罐内的DO水平对菌体生长和产量都有显著影响[6]。一般来说,发酵液中较高的DO条件有利于增强碳源的利用效率,增大碳代谢通量,从而提高发酵生产效率[22]。然而过量的DO水平也可能会导致胞内活性氧的过量积累,从而引起细胞氧化应激作用,最终导致细胞提早衰亡[23]。对于生物发酵过程,其不同阶段的最适DO存在差异,因此在不同的发酵阶段按需供氧显得十分必要[24]

根据2.1中WG-608的恒定pH发酵特征,将240 h发酵过程中的DO分为2个阶段进行优化,即菌体生长期(0~72 h)和产物合成期(72~240 h)。

2.3.1 DO对菌体生长期ε-PL发酵的影响

在pH 4.0的条件下,将发酵罐内DO分别控制在20%、30%、40%,于5 L罐内进行72 h的分批-补料发酵。结果表明,DO维持在40%时,产量和DCW均达到最高,分别为19.30和39.77 g/L(表2)。说明该阶段ε-PL合成的最适DO为40%。因此,选择40%的DO水平作为菌体生长期的最适DO。

表2 菌体生长期DO对WG-608 ε-PL 产量的影响
Table 2 Effect of dissolved oxygen on ε-PL production by S.albulus WG-608 during the growth period

发酵参数DO/%302040DCW/(g·L-1)35.94±1.69 35.51±1.59 39.77±1.84∗∗产量/(g·L-1)17.12±0.6017.00±0.6019.30±0.68∗单位菌体合成能力/(g·g-1)0.477±0.0060.507±0.0060.487±0.006平均比生长速率/d-11.860±0.007 1.850±0.007 1.873±0.006 平均比生产速率/d-10.92±0.020.98±0.020.94±0.01

2.3.2 DO对产物合成期ε-PL发酵的影响

基于2.3.1的实验结果,将0~72 h的DO控制在40%,将72 h后的DO分别维持在10%、20%、30%,以探索发酵后期DO对ε-PL发酵的影响。图2表明,将发酵后期的DO控制于20%,菌体量和产量均达到最高,分别达到57.13 和66.24 g/L。因此在产物合成期确定DO控制于20%更有利于小白链霉菌生产ε-PL。

a-菌体干重(DCW);b-ε-PL产量
图2 不同DO条件下WG-608产物合成期生产ε-PL
Fig.2 ε-PL production by S.albulus WG-608 under different dissolved during the production synthesis period

2.4 pH-DO组合调控策略的建立

综合上述结果,建立了pH-DO组合调控策略。整个策略分为2个阶段,第一阶段(0~72 h),pH从6.8自然下降并维持在4.0,同时DO从初始的100%下降并维持在40%;第二阶段(72~240 h),DO控制在20%,pH控制于4.3。图3-a显示,经pH-DO组合策略调控,WG-608的DCW在72 h经短暂的停滞后,持续增长,这与原始策略显然有很大的不同(图1)。随着菌体生长速率的增加,ε-PL的产量积累明显高于对照策略。最终经240 h的发酵,ε-PL产量与平均比合成速率分别可达(68.77±2.53) g/L和(2.33±0.08) d-1,较原始策略分别提升了28.23%和12.02%(表3)。

表3 不同策略对WG-608生产ε-PL的影响
Table 3 Effect of ε-PL production by S.albulus WG-608 under different fermentation strategy

恒定pHpH-DO组合调控提升百分比DCW/(g·L-1)48.19±0.1157.94±0.81∗∗20.23%产量/(g·L-1)53.63±0.7868.77±2.53∗∗28.23%葡萄糖转化率/(g·g-1)10.30%±0.42%10.99%±0.32%∗6.70%单位菌体合成能力/(g·g-1)1.11±0.021.19±0.037.21%平均比生长速率/d-11.74±0.081.92±0.0510.34%ε-PL产率/[g·(L·d)-1]5.36±0.086.88±0.25∗∗28.23%ε-PL平均比合成速率/d-12.08±0.082.33±0.08∗12.02%

注:n=2

a-ε-PL发酵过程情况;b-菌体比生长速率;c-ε-PL比合成速率;d-葡萄糖消耗量
图3 pH-DO组合策略生产ε-PL
Fig.3 The ε-PL production by pH-DO combination strategy
注:图中相同时段恒定pH和pH-DO组合调控策略之间的差异,以*表示0.01<P<0.05,显著差异; **表示P<0.01,极显著差异,n=2,下同

图3-b显示,在0~72 h,pH-DO组合调控策略的日平均比生长速率显著高于对照策略,而72 h后2种策略之间无显著差异。而对于日平均比合成速率而言,pH-DO组合调控策略则在72 h后(除168 h)显现出了明显优势。此外,对2种策略下2个阶段葡萄糖的消耗总量进行统计(图3-d),结果发现在发酵第一阶段(0~72 h)的2种策略下的葡萄糖消耗总量无显著差异,而第二阶段(72~240 h),pH-DO组合调控策略的糖耗较原始策略显著提高,由315.5 g/L增长到528.8 g/L,增加了67.6%,葡萄糖转化率也提高了6.7%。以上结果说明,pH-DO组合调控策略主要通过前期增加单位菌体的合成速率,而后期增加对葡萄糖的消耗和单位菌体合成能力,最终提高了WG-608的ε-PL产量。

HUANG等[3]探究了菌体生长和产物合成的pH和DO差异的分析,发现菌体生长和产物合成的最佳pH和DO存在差异,因此建立了2阶段pH和DO控制策略,将菌体的生长和产物的合成分为2个阶段进行调控,最终使Mortierella alpina CCFM698的总脂肪酸和二十碳五烯酸的产量提高了10.7%和26.6%,与本文研究结果相似。尽管如此,pH-DO组合调控提高ε-PL产量的原因仍不清楚。

2.5 pH-DO组合调控发酵提高产量机制初探

2.5.1 pH-DO组合策略对ε-PL合成途径的关键酶活性的影响

2.4中分析了2种策略的基本发酵参数的差异,发现经pH-DO组合调控策略,WG-608对底物消耗显著增加,推测该策略可能通过影响ε-PL的合成代谢,提高了对底物的摄取和利用。L-lys是ε-PL合成途径中的唯一前体,据报道,用于L-赖氨酸合成的碳骨架主要通过糖酵解途径、回补反应、磷酸戊糖(pentose phosphate, PP)途径和三羧酸(tricarboxylic acid,TCA)循环提供。因此,对不同发酵时期的4种关键酶,PEPC、G6PDH、CS、AK的活性进行检测和分析,以进一步了解pH-DO组合调节对ε-PL合成和细胞生长的影响。

G6PDH是糖酵解途径进入磷酸戊糖途径(PP途径)的关键限速酶,其活性决定了PP途径代谢通量的大小。由图4-a可知G6PDH的活性在48 h显著提高,在其余时段也相对更高,这与2.4中在DO 40%期间比生长速率显著提高一致。说明在pH-DO调控策略下,流入PP途径的碳通量明显增加,为WG608菌体的生长与L-lys的合成提供了更多的戊糖和NADPH。对胞内NADPH水平的检测也印证了这一推测(图5-a)。由于在pH-DO组合调控策略下细胞生长更好,PP途径的增强似乎是一种对细胞生长需求的响应。

a-G6PDH;b- PEPC;c-CS;d- AK;e-PLS
图4 pH-DO组合策略与恒定pH策略下关键酶活性的比较
Fig.4 Comparison of key enzyme activities of metabolic pathways with pH-DO strategy and constant pH strategy

TCA循环是能量代谢的中枢,也是细胞提供ATP和FADH2的主要途径。CS是草酰乙酸进入TCA循环的第一个酶。图4-c可知,随发酵的进行,2种策略中的CS的变化趋势基本一致。96 h后pH-DO策略中的CS活性显著提高,这可能驱动TCA循环产生更多的 NADH 和 FADH2,并通过呼吸链和氧化磷酸化途径合成更多的ATP。此外,增强的TCA循环可以为L-lys的生物合成提供更多的前体草酰乙酸(oxaloacetic acid, OAA)。TCA循环的许多其他中间代谢物,如柠檬酸和α-酮戊二酸,也是碳水化合物、脂质或氨基酸生物合成的重要前体。总之,pH-DO策略增强了TCA循环的代谢通量,为快速合成ε-PL和菌体量补充了足够的能量和前体。

回补反应是PPC(PEP+CO2+ADP→OAA)补充OAA消耗的另一个重要途径。从图4-b可以看出,pH-DO组合调控策略中,PPC的活性高于对照组,可以为L-lys的合成回补更多的OAA前体。AK是L-赖氨酸生物合成中的关键酶。96 h后pH-DO策略中的AK活性也明显更高(图4-d),表明pH-DO的组合调节明显增强了L-赖氨酸合成途径的代谢通量,从而促进了L-lys和ε-PL的合成。

PLS在2种发酵工艺中的变化趋势较为一致,在96 h前逐渐升高至最大值,随后开始降低。然而,pH-DO组合调控策略的发酵后期酶活力仍保持着相对较高的活力,这与2.4中产物比合成速率的趋势较为一致,PLS在后期保持着较高水平的酶活力,这可能是pH-DO策略下发酵后期的比合成速率更高的原因。以上结果表明,经过pH-DO组合调控策略通过增强WG-608在整个发酵过程中的代谢活力和碳代谢通量,促进细胞摄取了更多的底物,以提高ε-PL的产量。

2.5.2 pH-DO组合策略对胞内辅因子的影响

大量研究证明,NAD(P)H是胞内氧化还原反应的重要辅因子,有利于胞内氧化还原的平衡,促进细胞的生长和NAD(P)H依赖性产物的合成,而1分子的L-lys的合成就需要消耗4当量的NADPH[25]。此外,PLS在利用前体L-lys合成ε-PL的过程中需要消耗大量ATP,且高浓度的ATP可以激活PLS的活性[16]。因此,胞内辅因子的浓度对L-lys与ε-PL的合成具有很大影响。在2.5.1的结果中,通过检测代谢途径的关键酶活性,推测pH-DO组合策略可能增大了碳代谢通量,但其对胞内辅因子带来的影响,还需进一步评估。

大多数胞内ATP是通过呼吸链和氧化磷酸化产生的。由图5-a的电子传递链强度检测结果可以发现,pH-DO组合调控策略的电子传递能力更高,基本达到极显著水平(P<0.01),电子传递过程耦合了ATP的形成,表明ATP的合成能力在pH-DO策略中也被增强了。由图5-b中可知,pH-DO组合调控策略中的胞内ATP浓度在整个发酵过程中呈下降的趋势。而在恒定发酵过程中,ATP在前96 h下降,但96 h后却开始积累。同时,96 h后,pH-DO组合调控策略中的胞内ATP浓度显著低于对照组,这与预期截然相反。结合PLS活性在96 h 后仍保持着较高水平的情况,推测由于PLS的活性增强,大量合成的ε-PL增加了胞内ATP的消耗,以致最终胞内ATP浓度较低。

a-电子呼吸链;b-ATP;c-NADH;d-NAD+/NADH;e-NADPH;f-NADP+/NADPH
图5 发酵过程中生理参数比较
Fig.5 Comparison of Physiological Parameters in Fermentation Processes

如图5-c和图5-d所示,2种策略中的胞内NADH水平呈波动变化,且pH-DO组合调控策略中的NADH水平基本高于对照。类似,NAD+/NADH的比值略微高于对照,说明pH-DO策略提高了NADH的利用率。pH-DO组合调控策略中NADPH水平在48和96 h时高于对照组,而在168和240 h低于对照,而NADPH的利用率(NADP+/NADPH)与上述结果恰恰相反。结合2.4的结果,推测虽然pH-DO调控策略增强了NADPH的供应量,但由于发酵后期NADPH被大量用于L-lys的合成,导致胞内实际NADPH水平下降。

综合上述结果,可以发现pH-DO组合调控策略在提高胞内ATP、NADH和NADPH合成代谢的同时,也增强了其分解代谢。总的来说,经pH-DO调控,胞内总体代谢活力更强,为ε-PL和菌体的合成提供了更多的前体或中间代谢物。

3 结论

本研究表明,根据ε-PL高产菌S.albulus WG-608对发酵条件的需求,在发酵的不同阶段对pH和DO进行不同控制,可以显著提高S.albulus WG-608的ε-PL合成能力。采用新建立的pH-DO组合调控策略进行240 h的补料分批发酵后,WG-608的ε-PL产量和平均比合成速率达到68.77 g/L和2.33 d-1,比对照组(48.19 g/L和2.08 d-1)分别提高了28.33%和12.02%。进一步探究表明,该策略通过增强中心碳代谢途径、L-lys与ε-PL合成途径关键酶活性,增强WG-608对底物的摄取能力以及底物朝向ε-PL的代谢通量,最终提高了ε-PL的产量与比合成速率。胞内辅因子NADH、ATP与NADPH的合成增强,为L-lys与ε-PL的合成提供了足够的还原力和能量。本研究所获得的结果有助于ε-PL的大规模工业化生产。此外,由于pH-DO组合调控策略下ε-PL大量合成,促使游离胞内辅因子(ATP和NADPH)的含量大幅降低,有可能出现供不应求的状态。因此,后期可以考虑利用代谢工程手段提高胞内辅因子的供应量和利用率,以期进一步提高小白链霉菌ε-PL的生产效率。

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Enhancing the epsilon-poly-L-lysine biosynthesis of Streptomyces albulus by a pH-DO combined regulation strategy

WU Mengping1,2, WANG Liang1,2, ZHANG Jianghua1,2, ZHANG Hongjian1,2, CHEN Xusheng1,2*

1(School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi 214122, China) 2(The Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education, Jiangnan University, Wuxi 214122, China)

ABSTRACT ε-Poly-L-lysine (ε-PL) is a kind of food preservatives mainly produced by Streptomyces albulus, which possesses excellent antimicrobial activity and has broad industrial applications. In this study, the pH and dissolved oxygen (DO) levels in the fed-batch fermentation by an ε-PL high-producing strain S. albulus WG-608 were systemically optimized, and a novel pH-DO regulation strategy was subsequently established. Specifically, the fermentation process was divided into two stages: stage I, DO concentration and pH level were respectively kept at 40% and 4.0, for the accumulation of biomass and ε-PL; stage II, DO and pH levels were maintained at 20% and 4.3, to improve the specific formation rate and ε-PL production. After 240 h of fed-batch fermentation, the ε-PL production and average specific formation rate of WG-608 reached (68.77±2.53) g/L and (2.33±0.08) d-1, which were 28.23% and 12.02% higher than those of the control strategy. The total glucose consumption rate increased, especially the substrate consumption rate increased from 315.5 g/L to 528.8 g/L in the stage II, which increased by 67.6%. And the glucose conversion rate increased by 6.7%. Changes in key enzyme activities, respiratory chain activity, and intracellular nucleotide levels were detected and analyzed to further investigate the metabolic differences between the pH-DO regulation strategy and control strategy. The result showed that the enhanced glucose consumption rate, key enzyme activity of central carbon metabolism (include glucose-6-phosphate dehydrogenase, phosphoenolpyruvate carboxylase, citrate synthase, aspartokinase and ε-poly-L-lysine synthase), respiratory chain activity, L-lysine biosynthesis pathway are responsible for the improved ε-PL production by pH-DO regulation strategy. Overall, the novel pH-DO regulation strategy is a convenient and effective approach for promoting ε-PL biosynthesis by strengthening carbon and energy metabolism. As mentioned above, the new strategy increases the demand for energy, and the demand in the cell may be in short supply. To further increase the yield of ε-PL in S. albulus, balancing the intracelluar cofactors by metabolic engineering may become the next step research. This developed method has shed new light on the ε-PL production by other Streptomyces strains.

Key words epsilon-poly-L-lysine; Streptomyces albulus; food preservatives; pH; dissolved oxygen

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.031500

引用格式:吴梦萍,王靓,张建华,等.pH-DO组合调控策略提高小白链霉菌ε-聚赖氨酸的生物合成[J].食品与发酵工业,2023,49(5):9-17.WU Mengping, WANG Liang, ZHANG Jianghua, et al.Enhancing the epsilon-poly-L-lysine biosynthesis of Streptomyces albulus by a pH-DO combined regulation strategy[J].Food and Fermentation Industries,2023,49(5):9-17.

第一作者:硕士研究生(陈旭升教授为通信作者,E-mail:chenxs@jiangnan.edu.cn)

基金项目:国家重点研发计划项目(2020YFA0907700);江苏省自然科学基金项目(BK20191332, BK20190585);国家自然科学基金项目(31901622, 31671846)

收稿日期:2022-03-09,改回日期:2022-04-29