谷氨酰胺转氨酶耐热突变体在茂原链霉菌中的高效表达

张妮1,2,邱洁茹1,2,管杏子1,2,叶佳才1,2,刘松1*

1(江南大学 未来食品科学中心,江苏 无锡,214122)2(江南大学 生物工程学院,江苏 无锡,214122)

摘 要 谷氨酰胺转氨酶(EC 2.3.2.13 transglutaminase,TGase)能够催化蛋白质交联或被小分子进行修饰,是一种重要的工业酶。为提高耐热TGase的发酵水平,该研究在茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)诱变株smY2022Δtg中表达了TGase耐热突变体TGm2A,并分析了其酶学性质和高温条件下的蛋白交联能力。首先,分析了6种强启动子对TGm2A表达的影响,发现甘油醛-3-磷酸脱氢酶启动子(Pgapdh)获得的TGm2A产量最高,达到31.48 U/mL。其次,通过将TGase启动子(PsmY2022-2)与Pgapdh串联构建得到启动了PsmY2022-2/gapdh,使TGm2A产量提高至64.94 U/mL。在此基础上,构建了TGm2A基因双拷贝菌株smY2022-TGm2A-2C,其发酵84 h后酶活力达到93.62 U/mL,是目前报道的TGase产量最高的菌株。酶学性质分析表明,TGm2A在60 ℃半衰期达到120.36 min,是野生型的100倍。此外,TGm2A在70 ℃下对β-酪蛋白的交联能力显著优于野生型TGase。该研究将为TGase的工业化生产及其在高温条件加工中的应用奠定基础。

关键词 茂原链霉菌;谷氨酰胺转氨酶;分泌表达;启动子;拷贝数;催化特性

谷氨酰胺转氨酶(EC 2.3.2.13 transglutaminase,TGase)能够催化蛋白质谷氨酰胺残基与不同酰基受体之间形成ε-(γ-谷氨酸)异肽键[1],从而实现蛋白质的交联或通过小分子进行修饰[2]。微生物来源的TGase最初从茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)中分离,相较于动植物来源的酶,其具有不依赖Ca2+、生产成本低等显著优势[1]。因此,S.mobaraensis的发酵成为商业TGase的主要来源。目前,TGase已广泛应用于肉类、乳制品和豆制品等蛋白基食品的质地改良[3],并在抗体-药物偶联[4]、组织工程[5]和蛋白质聚乙二醇化[6]等领域展现出广阔的应用前景。然而,野生型S.mobaraensis来源的TGase在高温条件下的稳定性较差,其在50、60 ℃的半衰期分别仅为41.8、2 min。在实际应用中,TGase常暴露于高温环境,例如牛肉凝胶的生产需在60 ℃进行[7],而豆腐加工中的交联反应需在50 ℃进行[8]。因此,开发高效、热稳定的TGase对于其工业应用具有重要意义。

目前,随机突变和半理性设计已被用于提高S.mobaraensis来源TGase的热稳定性。通过随机突变和组合突变,研究人员获得了热稳定突变体TGm1(S2P-S23V-Y24 N-S199A-K294L),其在60 ℃的半衰期达到24.3 min,是野生型的11.2倍[9];此外,基于理性设计,本研究通过脯氨酸扫描结合折叠能量分析构建了TGm2(S2P-S23V-Y24 N-E28T-S199A-A265P-A287P-K294L),其在60 ℃的半衰期达到66.87 min,比酶活力也较野生型提高了1.9倍(71.81 U/mg)[10]。在TGm2的基础上,再通过对远离底物结合口袋的柔性区域进行虚拟饱和突变获得TGm2A(FRAPD-TGm2-S116A-S179L),其在60 ℃下半衰期和比酶活力分别达到132.38 min和79.15 U/mg[11]。值得注意的是,上述热稳定突变体均在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达,其安全性和生产效率仍有待进一步提升。

除了大肠杆菌,S.mobaraensis来源的TGase已在多种宿主中表达,包括变铅青链霉菌(Streptomyces lividans)[12]、乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)[13]、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)[14]、毕赤酵母(Komagataella phaffii)[15]。在S.mobaraensis中,TGase以前体酶的形式合成,通过内源蛋白酶去除N端前体区域后转化为活性酶[16]。研究表明,成熟TGase区域的正确折叠依赖于前体区域,该区域还可通过抑制TGase活力降低细胞毒性[17]。然而,上述异源宿主中的TGase产量较低或以胞内蛋白形式存在。近年来,通过诱变育种和基因拷贝数优化,S.mobaraensis的TGase产量已提高至40 U/mL[18]。此外,S.mobaraensis是目前唯一被批准用于生产食品级TGase的菌株,相较于其他宿主,其在TGase生产中仍具显著竞争力。

前期研究对S.mobaraensis DSM40587进行常压室温等离子体(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)诱变,产生 TGase 产生改善的突变菌株(smY2022);在此基础上,用 TGm2 替换了smY2022基因组中野生型TGase基因,所得重组菌胞外酶活力达61.7U/mL[19]。在本研究中,将热稳定性更好的TGm2A表达于smY2022Δtg,通过启动子工程和增加基因拷贝数等策略进一步提高其表达水平,并评估了重组酶的酶学性质和蛋白质交联性能。研究结果将有助于进一步推动TGase的工业化生产和应用。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 菌株与质粒

E.coli JM109用于基因克隆。E.coli ET12567/pUZ8002(Invitrogen,Carlsbad,USA)用于链霉菌接合转移[19]S.mobaraensis TGase基因缺失菌株smY2022Δtg用于TGase表达。质粒pUC19和pET-28a(+)用作基因克隆。pUC-TGm2A是pUC19的衍生质粒,编码TGm2A基因(链霉菌密码子偏好性);pET-28a(+)-Promoters是pET-28a(+)的衍生质粒,编码启动子PrpsL、PkasO*、PermE*、PSP44和Pgapdh[20];TGm2A基因及启动子基因均由生工生物工程(上海)股份有限公司构建。质粒pSET152用于S.mobaraensis基因整合。质粒pCRISPomyces-2编码CRISPR/Cas9系统[21],用于S.mobaraensis基因整合。

1.1.2 主要试剂

高保真DNA聚合酶、一步克隆连接试剂盒,南京诺唯赞生物科技股份有限公司;质粒提取试剂盒、柱回收试剂盒、氯霉素、卡那霉素、安普霉素和氨苄青霉素,生工生物工程(上海)股份有限公司;大肠杆菌感受态细胞制备试剂盒、RNA提取试剂盒、反转录试剂盒和荧光PCR试剂盒,宝生物工程(大连)有限公司;蛋白Marker、蛋白电泳 Loading buffer、Bis-Tris 预制凝胶,赛默飞世尔科技(中国)有限公司;Bradford 蛋白浓度测定试剂盒,上海碧云天生物技术有限公司;酪蛋白,上海麦克林生化科技股份有限公司;PrePack SP Purose 6 Fast Flow阳离子交换柱,嘉兴千纯生物科技有限公司;其他生物学试剂均购自国药集团化学试剂公司。

1.1.3 培养基及缓冲液

LB培养基(g/L):酵母提取物 5,蛋白胨 10,NaCl 5,pH 7.0。固体培养基中添加1.5%~2%质量分数的琼脂。

GYM(glucose yeast malt)琼脂培养基(g/L):葡萄糖10,酵母粉4,麦芽粉3,琼脂粉20。

MS(murashige and skoog)琼脂培养基(g/L):甘露醇20,麦芽提取物2.5,大豆粉20,琼脂20;50 mmol/L MgCl。

种子培养基(g/L):甘油20,酵母粉5,胰蛋白胨20,K2HPO4 4,MgSO4 2,pH 7.2。

发酵培养基(g/L):甘油20,鱼粉蛋白胨25,酵母粉5,玉米浆粉5.5,(NH4)2SO4 5.5,K2HPO4 2,MgSO4 2,pH 7.2~7.4。

1.2 仪器与设备

AKTA 蛋白纯化仪,美国 GE Healthcare 公司;台式高速冷冻离心机,德国 Eppendorf 公司;Light Cycler 480 荧光定量PCR仪,瑞士罗氏公司;国产PCR仪,杭州博日科技。

1.3 实验方法

1.3.1 质粒构建

基于pSET152构建含有不同启动子的TGm2A整合表达质粒。用引物对rpsL-F/rpsL-R、kasO*-F/kasO*-R、ermE*-F/ermE*-R、SP44-F/SP44-R和gapdh-F/gapdh-R分别从pET-28a(+)-Promoters扩增启动子PrpsL、PkasO*、PermE*、PSP44和Pgapdh基因片段。通过引物对TGm2A-F/TGm2A-R从pUC-TGm2A扩增TGm2A基因片段。用引物smY2022-2-F/smY2022-2-R从smY2022基因组扩增启动子PsmY2022-2基因片段。用引物对zai-F/zai-R扩增pSET152质粒骨架片段。基于一步克隆试剂盒,将上述不同启动子、TGm2A编码基因和pSET152质粒骨架片段连接,获得含有不同启动子的TGm2A的整合质粒。通过引物对smY2022-F1/smY2022-R1和gapdh-F1/gapdh-R1分别从smY2022基因组和pET-28a(+)-Promoters扩增PsmY2022-2和Pgapdh基因片段,并与用引物对zai-F/zai-R从上述pSET152衍生质粒扩增含有TGm2A的pSET152质粒骨架片段连接,获得含融合启动子PsmY2022-2/gapdh的TGm2A整合表达质粒pSET152-PsmY2022-2/gapdh-TGm2A。类似地,通过smY2022-F2/smY2022-R2和gapdh-F2/gapdh-R2进行PCR扩增及基因克隆,构建得到含融合启动子Pgapdh/smY2022-2的TGm2A整合表达质粒pSET152-Pgapdh/smY2022-2-TGm2A。

基于pCRISPomyces-2构建attB整合质粒。使用CRISPOR(https://crispor.gi.ucsc.edu/)设计靶向smY2022Δtg TGase基因位点的sgRNA序列,并合成对应的引物对sgtg-F/sgtg-R。通过单链退火,形成带有黏性末端的双链sgRNA片段。将该双链sgRNA片段与经限制性内切酶Bbs Ⅰ切割后的pCRISPomyces-2连接,构建得到含有sgRNA的质粒pCRISPR-sgtg。以smY2022基因组为模板,通过引物tg-FF/tg-FR和tg-RF/tg-RR分别扩增融合attB(34 bp)的TGase基因上游L1000(1 kb)及下游同源臂R1000(1 kb)。同时,通过一步克隆试剂盒将L1000和R1000与经Xba Ⅰ切割的pCRISPR-sgtg连接,构建得到在TGase基因位点整合attB基因的质粒pCRISPR-attB

上述质粒构建过程中所涉及引物序列如表1所示。

表1 本研究使用的引物序列

Table 1 Primers used in this study

引物名称 引物序列(5′-3′)TGm2A-FATGTCCCAACGCGGGAGAACTCTTGm2A-RTCGATATCGCGCGCGGCCGCGGTGGGGAGGGGAGCCGGATsmY2022-2-FGGCTGCAGGTCGACTCTAGACGGACGGATTCCGCCGCACCCsmY2022-2-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATGAAGAACAACAACTCCTTTGGCGAACGTGACrpsL-FGACGGCCAGTGCCAAGCTTGGCCCTGCAGGCGGAAGTCAGGTAGArpsL-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATTACGTCTCCGTCGTCTTCTCGAGCTCkasO∗-FGACGGCCAGTGCCAAGCTTGTGTTCACATTCGAACCGTCTCTGCTkasO∗-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATAACTCCCCCAGTCCTGCACGCTGTCermE∗-FGACGGCCAGTGCCAAGCTTGGGTACCAGCCCGACCCGAGCACermE∗-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATGTGGTGTCCTACCAACCGGCACGATTGTCSP44-FGACGGCCAGTGCCAAGCTTGTGTTCACATTCGAACCGTCTCTGCTSP44-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATAACTCCCCCAGTCCTGCACGCTGTCgapdh-FGACGGCCAGTGCCAAGCTTGGCTGCTCCTTCGGTCGGACGTGCGTgapdh-RGTTCTCCCGCGTTGGGACATGCGTATCCCCTTTCAGATACTCGCACTAAGzai-FATGTCCCAACGCGGGAGAACTCTCGTzai-RTCTAGAGTCGACCTGCAGCCCAAGCTTGG2022-F1GGCTGCAGGTCGACTCTAGACGGACGGATTCCGCCGCACCC2022-R1GAAGAACAACAACTCCTTTGGCGAACGTGACgapdh -F1GAAGAACAACAACTCCTTTGGCTGCTCCTTCGGTCGGACGgapdh -R1GTTCTCCCGCGTTGGGACATGCGTATCCCCTTTCAGATACTCGCACTAAGA2022-F2GCGTATCCCCTTTCAGATACCGGACGGATTCCGCCGCACCC2022-R2 ACGAGAGTTCTCCCGCGTTGGGACATGAAGAACAACAACTCCTTTGGCGAACgapdh-F2GGCTGCAGGTCGACTCTAGAGAAGAACAACAACTCCTTTGGCGAACGTGACgapdh-R2GCGTATCCCCTTTCAGATACTCGCACTAAGAtg-FFCCGGGGAGCCGAAGGGCACCCCCTGGCACCTACAGCTCGTGGCCCGTCGTGCTGTCCtg-FRGCCGGGCGTTTTTTATCTAGAGTGGTGCACGTACAGGTACGACGGTtg-RFCCGGGGAGCCCAAGGGCACGCCCTGGCACCTACAGCTCGTGGCCCGTCGTGCTGTCCtg-RRTTACGGTTCCTGGCCTCTAGCGCATGGACCAGTTCGGCATCCCGTAsgtg-FACGCCGACCCTGCTGCGTCGATGAsgtg-RAAACTCATCGACGCAGCAGGGTCGver-F1CAACGACGGCAACGACCTGGAGATCATTver-R1AGCCCGCCGGAGACCACCAGTTver-F2GCTTCATACAGGTCCGGATGGCGCGAver-R2CAACGACGGCAACGACCTGGAGATCATT

注:Gibson组装的同源序列用下划线突出显示。

1.3.2 S.mobaraensis转化

TGm2A整合表达质粒或attB整合质粒被分别转化至非甲基化的E.coli ET12567/pUZ8002中。在含有25 μg/mL氯霉素、50 μg/mL卡那霉素和100 μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中于37 ℃培养2 h后,收集重组E.coli并与在50 ℃预热10 min的smY2022Δtg孢子悬浮液混合。将悬浮液涂布在MS琼脂培养基上,于30 ℃下培养16 h。最后,使用添加有10 μg/mL的安普霉素(apramycin,Apr)GYM琼脂培养基培养7~9 d。通过PCR验证和基因测序分析筛选出阳性转化子。其中,引物对ver-F2/ver-R2用于验证在TGase基因位点整合attB或TGm2A基因的转化子,ver-F1/ver-R1用于验证在attB基因位点整合TGm2A基因的转化子。

1.3.3 重组S.mobaraensis 摇瓶发酵

S.mobaraensis阳性转化子接种于GYM平板,于30 ℃培养5~7 d。待菌落形成后,刮取孢子和菌丝,接种至含有30 mL种子培养基的250 mL摇瓶中,在30 ℃、220 r/min的条件下培养24 h。随后,以8%(体积分数)的接种量将种子液转接至含有30 mL发酵培养基的250 mL摇瓶中,置于30 ℃、220 r/min的摇床中进行发酵培养。培养期间,每隔12 h取样1次,共计培养96 h。取样后,将样品置于4 ℃、10 000 r/min的条件下离心10 min,收集上清液,用于后续分析。

1.3.4 蛋白纯化

利用PrePack SP Sepharose 6 Fast Flow阳离子交换柱,从S.mobaraensis发酵上清液中纯化野生型TGase或TGm2A [22]。首先,将发酵上清液与-20 ℃预冷的无水乙醇按3∶7体积比混合,置于4 ℃冰箱中静置30 min。随后,以10 000 r/min的转速离心10 min,收集蛋白沉淀。将沉淀溶解于50 mmol/L(pH 5.5)的乙酸盐缓冲液中,并使用0.2 μm针头式过滤器进行过滤,以去除杂质和颗粒。将过滤后的酶溶液以2 mL/min的流速加载至阳离子交换柱中。首先,用20 mL A液(50 mmol/L 乙酸-乙酸钠缓冲液,pH 5.5)平衡层析柱;接着,用10%(体积分数)B液(50 mmol/L 乙酸-乙酸钠缓冲液,pH 5.5;150 mmol/L NaCl)进行除杂处理,持续30 min;最后,用60%(体积分数)B液进行洗脱,收集目标蛋白。纯化后的蛋白溶液进一步通过10 kDa 超滤管进行脱盐处理,以去除盐等小分子杂质,得到高纯度的目标蛋白。

1.3.5 酶学性质测定

酶60 ℃半衰期测定方法如下:将纯化后的酶用50 mmol/L、pH 8.0的Tris-HCl缓冲液稀释至0.4~0.6 mg/mL,置于60 ℃恒温条件下孵育120 min。在孵育过程中,于特定时间点取样,并测定样品的TGase活力。残活性计算如公式(1)所示:

残余酶活力

(1)

随后,利用Origin 2019软件中的ExpDec1函数对数据进行指数曲线拟合,通过拟合公式计算酶活力降至初始值50%时所需的时间(t1/2),以此确定酶的半衰期。为确定酶的最适反应温度,将野生型TGase和突变体TGm2A分别用50 mmol/L、pH 8.0的Tris-HCl缓冲液稀释至0.5 mg/mL,分别在37~70 ℃测定其相对酶活力。为确定酶的最适反应pH值,重组菌发酵上清液经过乙醇沉淀和冷冻干燥处理后制备成酶粉,并溶解于pH 3.5~8.0的50 mmol/L Tris-HCl缓冲液中。随后,将不同pH值的酶溶液分别加入对应pH值的底物中,在37 ℃下启动TGase反应,通过测定不同pH条件下的酶活力。

1.3.6 蛋白质交联分析

本实验以酪蛋白为底物,研究野生型TGase及TGm2A蛋白质交联能力。将酪蛋白溶解于100 mmol/L、pH 7.0的醋酸缓冲液中,使其终质量浓度为3 mg/mL,向上述各蛋白质溶液中加入纯化的酶液(终质量浓度为0.02 mg/mL),并在70 ℃恒温水浴中进行40 min的蛋白质交联反应。在反应过程中,分别于5、10、20、40 min取样,将样品与8 mol/L尿素按3∶1体积比混合后,进行SDS-PAGE分析。

1.3.7 TGase酶活力测定

本实验采用比色法测定TGase的活力,以N-CBZ-Gln-Gly和羟胺为底物[23]。具体操作如下:取150 μL底物溶液置于37 ℃金属浴中预热10 min,随后加入60 μL发酵上清液,混合均匀后在37 ℃下反应10 min。反应结束后,加入60 μL终止试剂,并在525 nm处测定吸光度。TGase酶活力单位定义为:在37 ℃下,每分钟催化生成1 μmol L-谷氨酸-γ-单羟肟酸所需的酶量。

1.3.8 蛋白质分析

本实验采用Bradford蛋白定量试剂盒测定蛋白浓度。取30 μL发酵上清液与10 μL 5×Loading Buffer混合均匀后,置于98 ℃加热10 min,备用。随后,使用10% SDS-PAGE凝胶在120 V电压下运行60 min分离蛋白。染色步骤采用X-Strain SDS-PAGE极速染色液进行染色。以SeeBlue Plus2预染蛋白标准(3~198 kDa)作为蛋白质标准分子。

1.3.9 实时荧光定量PCR

取1 mL发酵至36 h的发酵液样品,于4 ℃冷冻离心机中以1 000 r/min离心10 min,收集菌体备用。按照 MiniBEST Plant RNA Extraction Kit试剂盒说明书提取RNA,并检测其浓度。随后,使用PrimeScriptTM RT试剂盒将RNA逆转录为cDNA。最后,在Light Cycler 480系统中,采用SYBR Green Ⅰ嵌合荧光法进行实时荧光定量PCR分析。以S.mobaraensis基因组中的hrdB基因为内参基因,通过2-ΔΔCt法计算不同样品中目标基因的相对表达倍数变化。

2 结果与分析

2.1 启动子筛选提高TGm2A的表达

启动子是影响重组蛋白表达的关键因素,研究者已经挖掘或者改造多个链霉菌强启动子。其中,红霉素抗性基因启动子PermE应用最为广泛为组成型强启动子[24]。此外,PkasO*和PSP44[25]是在天蓝色链霉菌SARP型调节因子启动子PkasO基础上改造得到的强启动子。Pgapdh和PrpsL是分别来源于灰色链霉菌中高转录水平的甘油醛-3-磷酸脱氢酶和30S核糖体蛋白S12(rpsL)基因的启动子[26]。为了提高TGm2A的产量,本研究将PrpsL、PkasO*、PermE*、PSP44和Pgapdh 5种启动子,以及来自链霉菌smY2022的内源性启动子PsmY2022-2[27],分别融合至TGm2A基因的上游,并通过pSET152质粒整合至smY2022ΔtgattB基因位点(图1-a)。对所得重组S.mobaraensis进行摇瓶发酵,取发酵60 h的上清液进行TGase酶活力及SDS-PAGE分析。

M为蛋白标准分子质量(Markeer,下同)。

a-TGm2A表达框结构;b-发酵上清液的TGase活力;c-发酵上清液SDS-PAGE分析

图1 启动子替换对TGm2A表达的影响

Fig.1 The effect of promoter substitution on the TGase expression

如图1-b所示,在Pgapdh和PsmY2022-2启动子的作用下,胞外TGase酶活力分别达到31.48、15.10 U/mL,而利用其他4种启动子的菌株均未在胞外检测到TGase活力(图1-b)。SDS-PAGE分析表明,采用Pgapdh和PsmY2022-2的菌株上清液呈现明显的TGm2A蛋白条带(38 kDa),且前者的条带更粗(图1-c)。因此,Pgapdh能有效提升TGm2A在S.mobaraensis中的表达水平。

2.2 启动子改造提高TGm2A的表达

串联启动子已被证明可以显著提高基因表达水平和蛋白质产量,并广泛应用于B.subtilis[28]E.coli[29]、酿酒酵母[30]K.phaffii[31]。在链霉菌中也有应用,TAO等[32]构建了一个诱导型启动子Ptip和组成型启动子PermE*的双启动子表达系统,用于磷脂酶D在S.lividans 中表达。为了提高TGm2A的表达水平,将高活性启动子Pgapdh与PsmY2022-2以不同顺序进行融合,分别得到串联启动子Pgapdh/smY2022-2和PsmY2022-2/gapdh(图2-a)。基于质粒pSET152将上述串联启动子表达框整合至smY2022ΔtgattB基因位点。对所得重组S.mobaraensis进行摇瓶发酵,取发酵上清液进行TGase酶活力及SDS-PAGE分析。

a-TGm2A表达框结构;b-发酵过程曲线;c-发酵上清液SDS-PAGE分析;d-TGm2A基因转录水平分析

图2 启动子串联对TGm2A表达量比较

Fig.2 The effect of promoter combination on the TGm2A expression

a-双拷贝菌株构建示意图;b-发酵过程曲线;c-发酵上清液的SDS-PAGE分析

图3 双位点整合对TGm2A表达的影响

Fig.3 The effect of double-site integration on the expression of TGm2A

结果表明,串联启动子PsmY2022-2/gapdh获得的TGase酶活力达到64.94 U/mL,分别是PsmY2022-2和Pgapdh的4.3倍和2.06倍(图2-b)。然而,Pgapdh/smY2022-2获得的TGase活性最低(图2-b)。SDS-PAGE分析表明,发酵60 h,PsmY2022-2/gapdh表达的TGm2A蛋白条带最粗,而Pgapdh/smY2022-2对应的蛋白条带最浅(图2-c)。上述结果,启动子串联能显著提高TGm2A的表达水平,启动子串连的顺序对其活性有重要影响。为进一步确认启动子强度,基于qRT-PCR分析了重组菌株发酵36 h胞内TGm2A的基因转录水平。如图2-d所示,各启动子对应的相对TGm2A mRNA水平差异与其表达差异基本一致。其中,PsmY2022-2/gapdh对应的相对mRNA水平分别是PsmY2022-2和Pgapdh的4.12倍和1.98倍(图2-d)。因此,串联启动子主要通过强化TGm2A基因转录水平来提高其表达量。

2.3 增加基因拷贝提高TGm2A的表达

研究表明,将多个基因拷贝整合到基因组中可以显著提高蛋白质产量[18]。在链霉菌中,位点特异性重组是最常用的整合方法。质粒pSET152中attP在整合酶的作用下,通过单交换特异性的整合到链霉菌基因组的attB位点[33],是目前链霉菌最高效的基因整合策略之一。然而,smY2022基因组中只有1个attB位点,限制了目的基因多拷贝整合。为实现TGm2A的多点整合表达,本研究利用CRISPR/Cas9系统在smY2022Δtg的TGase基因位点插入了额外的attB基因,然后通过质粒pSET152分别在2个attB位点整合采用串联启动子PsmY2022-2/gapdh的TGm2A表达框,得到重组菌smY2022-TGm2A-2C(图3-a)。将上述采用PsmY2022-2/gapdh启动子仅在smY2022Δtg天然attB位点整合表达TGm2A的菌株命名为smY2022-TGm2A。对重组S.mobaraensis进行摇瓶发酵,取发酵上清液进行TGase酶活力及SDS-PAGE分析。

发酵过程曲线如图3-b所示。在发酵前60 h,smY2022-TGm2A-2C胞外TGase酶活力略低于smY2022-TGm2A。在发酵72 h后,smY2022-TGm2A-2C的TGase酶活力超过smY2022-TGm2A,且酶活力快速升高,发酵84 h酶活力达到最大值(93.62 U/mL)(图3-b)。然而,smY2022-TGm2A则在在发酵72 h达到最大值(64.94 U/mL)。上述结果表明增加TGm2A基因拷贝数能有效提高其在S.mobaraensis中的表达水平。据研究所知,本研究构建的smY2022-TGm2A-2C是目前报道的TGase产量最高的菌株[19],将有力推进其工业化生产。

值得注意的是,smY2022-TGm2A-2C达到TGase酶活力最大值的时间点较smY2022-TGm2A推迟12 h。大量的研究表明,S.mobaraensis TGase以酶原形成合成,经内源蛋白酶的切割而转化活性的成熟酶。SDS-PAGE显示,smY2022-TGm2A-2C在发酵前72 h较smY2022-TGm2A形成了更多的酶原,在84 h基本转化为成熟酶(图3-c)。因此,smY2022-TGm2A-2C有限的活化蛋白酶可能不足以迅速切割其大量合成酶原,导致了TGase酶活力最高的延后。为进一步提高TGm2A的发酵效率,将在后期研究中过量表达其活化蛋白酶,从而加速酶原的活化效率。

2.4 TGm2A酶学性质分析

本研究利用阳离子交换柱成功纯化了来自野生型S.mobaraensis TGase和来自smY2022-TGm2A-2C的TGm2A(图4-a),并对纯化后的野生型TGase和TGm2A的最适温度、最适pH和半衰期进行了测定和比较。结果显示,TGm2A在60 ℃条件下处理60 min后,仍保留50%以上的酶活力,其60 ℃的半衰期达到120.36 min,是野生型TGase的100倍(图4-b)。此外,TGm2A的最适温度为60 ℃,比野生型TGase的最适温度高10 ℃(图4-c),并且纯化后的TGm2A和野生型TGase的相对酶活力分别为78.63 U/mg和24.52 U/mg。在pH 5~8,TGm2A和野生型TGase均保持较高的活力(图4-d)。上述结果表明,smY2022-TGm2A-2C表达的TGm2A具有良好的耐高温性能,明显优于野生型TGase。

a-纯化酶SDS-PAGE分析;b-酶热稳定性分析;c-温度对酶活力的影响;d-pH对酶活力的影响

图4 TGm2A热稳定性及催化活性分析

Fig.4 The analysis on the thermal stability and catalytic activity of TGm2A

2.5 TGm2A高温条件下的蛋白交联能力分析

β-酪蛋白为测定TGase的蛋白质交联活性的常用蛋白[19]。为了比较TGm2A和野生型TGase在高温条件下的蛋白质交联潜力,将2种酶分别添加至β-酪蛋白溶液,在70 ℃下进行交联反应。通过SDS-PAGE分析β-酪蛋白交联反应过程。β-酪蛋白在加入TGm2A孵育5 min后条带开始明显变浅并且在蛋白胶加样口有大量蛋白质聚集,而加入野生型TGase后未发现交联现象(图5)。上述结果表明,TGm2A在高温条件下仍具备明显的蛋白交联活性,这将有助于其在牛肉凝胶和豆腐加工等高温环境中的应用。后续研究将采尺寸排阻色谱法来分析 TGm2A蛋白交联产物,以期进一步量化评估其蛋白交联性能。

泳道1~5分别表示野生型TGase和TGm2A与酪蛋白在70 ℃反应0、5、10、20、40 min。

图5 SDS-PAGE分析在70 ℃的酶促蛋白质交联过程

Fig.5 SDS-PAGE analysis of the enzyme-mediated protein cross-linking at 70 ℃

3 结论

本研究通过启动子优化和基因拷贝数增加,显著提升了TGase在S.mobaraensis中的表达水平。启动子优化发现PsmY2022-2/gapdh串联启动子可使胞外TGase酶活力分别达到64.94 U/mL,显著优于其他启动子组合。进一步利用实现了TGm2A在S.mobaraensis双位点整合,构建的菌株smY2022-TGm2A-2C在发酵84 h后酶活力达到93.62 U/mL,成为目前报道的TGase产量最高的菌株。TGm2A在60 ℃条件下的半衰期长达120.36 min,是野生型的100倍,且最适温度为60 ℃,在pH 5~8保持较高活力。此外,TGm2A在70 ℃下对β-酪蛋白的交联能力显著优于野生型TGase,显示出优异的高温交联性能。这些结果不仅为TGase的工业化生产提供了高效的表达系统,还为其在高温食品加工等领域的应用奠定了基础,具有重要的科学和应用价值。

参考文献

[1] SANTHI D,KALAIKANNAN A,MALAIRAJ P,et al.Application of microbial transglutaminase in meat foods:A review[J].Critical Reviews in Food Science and Nutrition 2017,57(10):2071-2076.

[2] AKBARI M,RAZAVI S H,KIELISZEK M.Recent advances in microbial transglutaminase biosynthesis and its application in the food industry[J].Trends in Food Science &Technology,2021,110:458-469.

[3] DUARTE L,MATTE C R,BIZARRO C V,et al.Review transglutaminases:Part Ⅱ-industrial applications in food,biotechnology,textiles and leather products[J].World Journal of Microbiology &Biotechnology,2019,36(1):11.

[4] NISHIOKA R,IIDA R,MINAMIHATA K,et al.Transglutaminase-mediated proximity labeling of a specific Lys residue in a native IgG antibody[J].Chemical Communications 2024,60(65):8545-8548.

[5] K,KNEZ Ž,LEITGEB M.Transglutaminase in foods and biotechnology[J].International Journal of Molecular Sciences,2023,24(15):12402.

[6] DA SILVA FREITAS D,MERO A,PASUT G.Chemical and enzymatic site specific PEGylation of hGH[J].Bioconjugate Chemistry,2013,24(3):456-463.

[7] DONDERO M,FIGUEROA V,MORALES X,et al.Transglutaminase effects on gelation capacity of thermally induced beef protein gels[J].Food Chemistry,2006,99(3):546-554.

[8] LIU J,YANG S R,TANG R Y,et al.Enhanced tofu quality through calcium sulfate and transglutaminase treatment:Physicochemical properties and digestibility analysis[J].International Journal of Food Science and Technology,2024,59(10):7610-7618.

[9] BUETTNER K,HERTEL T C,PIETZSCH M.Increased thermostability of microbial transglutaminase by combination of several hot spots evolved by random and saturation mutagenesis[J].Amino Acids,2012,42(2-3):987-996.

[10] WANG X L,DU J H,ZHAO B C,et al.Significantly improving the thermostability and catalytic efficiency of Streptomyces mobaraenesis transglutaminase through combined rational design[J].Journal of Agricultural and Food Chemistry,2021,69(50):15268-15278.

[11] YANG P H,WANG X L,YE J C,et al.Enhanced thermostability and catalytic activity of Streptomyces mobaraenesis transglutaminase by rationally engineering its flexible regions[J].Journal of Agricultural and Food Chemistry,2023,71(16):6366-6375.

[12] NODA S,MIYAZAKI T,TANAKA T,et al.High-level production of mature active-form Streptomyces mobaraensis transglutaminase via pro-transglutaminase processing using Streptomyces lividans as a host[J].Biochemical Engineering Journal,2013,74:76-80.

[13] MA T G,LU J J,ZHU J,et al.The secretion of Streptomyces monbaraensis transglutaminase from Lactococcus lactis and immobilization on porous magnetic nanoparticles[J].Frontiers in Microbiology,2019,10:1675.

[14] WANG S T,YANG Z G,LI Z J,et al.Heterologous expression of recombinant transglutaminase in Bacillus subtilis SCK6 with optimized signal peptide and Codon,and its impact on gelatin properties[J].Journal of Microbiology and Biotechnology,2020,30(7):1082-1091.

[15] AQEEL S M,ABDULQADER A A,DU G C,et al.Integrated strategies for efficient production of Streptomyces mobaraensis transglutaminase in Komagataella phaffii[J].International Journal of Biological Macromolecules,2024,273:133113.

[16] ZOTZEL J,KELLER P,FUCHSBAUER H L.Transglutaminase from Streptomyces mobaraensis is activated by an endogenous metalloprotease[J].European Journal of Biochemistry,2003,270(15):3214-3222.

[17] JUETTNER N E,SCHMELZ S,ANDERL A,et al.The N-terminal peptide of the transglutaminase-activating metalloprotease inhibitor from Streptomyces mobaraensis accommodates both inhibition and glutamine cross-linking sites[J].The FEBS Journal,2020,287(4):708-720.

[18] YIN X Q,LI Y Y,ZHOU J W,et al.Enhanced production of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis through random mutagenesis and site-directed genetic modification[J].Journal of Agricultural and Food Chemistry,2021,69(10):3144-3153.

[19] YE J C,YANG P H,ZHOU J W,et al.Efficient production of a thermostable mutant of transglutaminase by Streptomyces mobaraensis[J].Journal of Agricultural and Food Chemistry,2024,72(8):4207-4216.

[20] BAI C X,ZHANG Y,ZHAO X J,et al.Exploiting a precise design of universal synthetic modular regulatory elements to unlock the microbial natural products in Streptomyces[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2015,112(39):12181-12186.

[21] WANG Y,COBB R E,ZHAO H.High-efficiency genome editing of Streptomyces species by an engineered CRISPR/Cas system[J].Methods in Enzymology,2016,575:271-284.

[22] PASTERNACK R,DORSCH S,OTTERBACH J T,et al.Bacterial pro-transglutaminase from Streptoverticillium mobaraense:Purification,characterisation and sequence of the zymogen[J].European Journal of Biochemistry,1998,257(3):570-576.

[23] LIU S,WANG M,DU G C,et al.Improving the active expression of transglutaminase in Streptomyces lividans by promoter engineering and Codon optimization[J].BMC Biotechnology,2016,16(1):75.

[24] BIBB M J,JANSSEN G R,WARD J M.Cloning and analysis of the promoter region of the erythromycin resistance gene (ermE) of Streptomyces erythraeus[J].Gene,1985,38(1-3):215-226.

[25] MYRONOVSKYI M,LUZHETSKYY A.Native and engineered promoters in natural product discovery[J].Natural Product Reports,2016,33(8):1006-1019.

[26] SHAO Z Y,RAO G D,LI C,et al.Refactoring the silent spectinabilin gene cluster using a plug-and-play scaffold[J].ACS Synthetic Biology,2013,2(11):662-669.

[27] 叶佳才.耐热谷氨酰胺转氨酶在茂原链霉菌中的表达研究[D].无锡:江南大学,2024.YE J C.Expression of thermostable transglutaminase in Streptomyces mobaraensis[D].Wuxi:Jiangnan University,2024.

[28] YAO D B,HAN X D,GAO H H,et al.Enhanced extracellular production of raw starch-degrading α-amylase in Bacillus subtilis through expression regulatory element modification and fermentation optimization[J].Microbial Cell Factories,2023,22(1):118.

[29] LIU L Y,NING N Y,XU S M,et al.Double promoter and tandem gene strategy for efficiently expressing recombinant FGF21[J].Microbial Cell Factories,2024,23(1):171.

[30] WU Y J,FENG S,SUN Z A,et al.An outlook to sophisticated technologies and novel developments for metabolic regulation in the Saccharomyces cerevisiae expression system[J].Frontiers in Bioengineering and Biotechnology,2023,11:1249841.

[31] YADAV D,RANJAN B,MCHUNU N,et al.Enhancing the expression of recombinant small laccase in Pichia pastoris by a double promoter system and application in antibiotics degradation[J].Folia Microbiologica,2021,66(6):917-930.

[32] TAO H,ZHANG Y C,DENG Z X,et al.Strategies for enhancing the yield of the potent insecticide spinosad in Actinomycetes[J].Biotechnology Journal,2019,14(1):e1700769.

[33] SIOUD S,AIGLE B,KARRAY-REBAI I,et al.Integrative gene cloning and expression system for Streptomyces sp.US 24 and Streptomyces sp.TN 58 bioactive molecule producing strains[J].Journal of biomedicine &Biotechnology,2009(1):464986.

Efficient production of a thermostable variant of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis

ZHANG Ni1,2,QIU Jieru1,2,GUAN Xingzi1,2,YE Jiacai1,2,LIU Song1*

1(Science Center for Future Foods,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)2(School of Biotechnology,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)

ABSTRACT Transglutaminase (EC 2.3.2.13 TGase) is an important industrial enzyme capable of catalyzing protein cross-linking or modification by small molecules.To enhance the fermentation level of thermostable TGase,this study expressed the thermostable mutant TGm2A in the mutant strain smY2022Δtg of Streptomyces mobaraensis and analyzed its enzymatic properties and protein cross-linking ability under high-temperature conditions.Initially,the impact of six strong promoters on TGm2A expression was evaluated,revealing that the glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase promoter (Pgapdh) achieved the highest yield of TGm2A at 31.48 U/mL.Subsequently,by tandemly linking the TGase promoter (PsmY2022-2) with Pgapdh to form the promoter PsmY2022-2/gapdh,the yield of TGm2A was further increased to 64.94 U/mL.Building on this,a double-copy TGm2A strain,smY2022-TGm2A-2C,was constructed,which achieved an enzyme activity of 93.62 U/mL after 84 h of fermentation,making it the highest-yielding TGase strain reported to date.Enzymatic characterization indicated that TGm2A has a half-life of 120.36 min at 60 ℃,which is 100 times that of the wild type.Additionally,TGm2A demonstrated significantly superior cross-linking ability with β-casein at 70 ℃ compared to the wild-type TGase.This study lays the foundation for the industrial production of TGase and its application in high-temperature processing.

Key words Streptomyces mobaraensis; transglutaminase; secretory expression; promoter; copy number; catalytic property

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.042634

引用格式:张妮,邱洁茹,管杏子,等.谷氨酰胺转氨酶耐热突变体在茂原链霉菌中的高效表达[J].食品与发酵工业,2026,52(2):1-9.ZHANG Ni,QIU Jieru,GUAN Xingzi,et al.Efficient production of a thermostable variant of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis[J].Food and Fermentation Industries,2026,52(2):1-9.

第一作者:硕士研究生(刘松研究员为通信作者,E-mail:liusong@jiangnan.edu.cn)

基金项目:农业科技重大项目;国家自然科学基金项目(32071474)

收稿日期:2024-03-07,改回日期:2024-05-26