基于酶催化的新型L-丝氨酸检测方法的开发与优化

孙慕娇1,2,鞠建松1*,刘君2,魏亮2*

1(河北师范大学 生命科学学院,河北 石家庄,050024)2(中国科学院天津工业生物技术研究所,天津,300308)

摘要 L-丝氨酸是一种重要的非必需氨基酸,具有重要的生理功能,在食品、化妆品和医药等领域具有广泛的应用。微生物发酵法具有环境友好,条件温和,底物可再生等优势,是生产L-丝氨酸的理想方法,受到研究者的广泛关注。在L-丝氨酸工程菌种的选育和改造过程中,需要对大量的菌种进行评估,存在大量的L-丝氨酸分析和检测工作,但是目前L-丝氨酸检测方法存在灵敏度差、准确度低、步骤繁琐等问题,严重限制了L-丝氨酸样品的高通量快速评估和检测。针对上述问题,该研究利用L-丝氨酸-3-脱氢酶的催化特性,建立了一种简单快速、特异性高的L-丝氨酸检测方法。通过对L-丝氨酸-3-脱氢酶挖掘和酶学性质分析,建立了L-丝氨酸最佳的酶法检测体系,该体系包括50 mmol/L碳酸钠-碳酸氢钠(pH=9.5),3 mmol/L NADP+,来源于蚕豆农杆菌(Agrobacterium fabrum)的丝氨酸脱氢酶(L-serine dehydrogenase,SerDH)2 U/mL,检测温度为40 ℃。该研究建立的L-丝氨酸酶法检测方法具有简单快速、检测效率高等特点,在1~10 mmol/L L-丝氨酸的浓度范围具有良好的线性关系,R2达到0.996 5。该研究建立的L-丝氨酸酶法检测方法能够实现L-丝氨酸样品的高通量检测和评估,为L-丝氨酸工业菌种的高通量选育提供了重要的技术支撑。

关键词 L-丝氨酸;L-丝氨酸-3-脱氢酶;酶学性质分析;高通量检测方法

L-丝氨酸是一种重要的非必需氨基酸,具有重要的生理功能,参与体内蛋白质、脂肪和磷脂的合成与代谢过程,在食品、化妆品和医药领域具有广泛的应用[1]L-丝氨酸是构成蛋白质的基本氨基酸之一,是甘氨酸和半胱氨酸等氨基酸合成的关键前体物质,为蛋白质的形成提供必要的成分[2]L-丝氨酸在脂肪和脂肪酸的新陈代谢中扮演着关键角色,影响脂肪的分解和利用,维持体内脂肪代谢的平衡[3]L-丝氨酸还参与体内细胞膜磷脂、鞘磷脂、糖脂等生物分子的合成,调控细胞膜的制造与加工,以及肌肉组织和神经细胞鞘的合成,在细胞增殖和分化过程中发挥重要作用[3]。此外,作为细胞内重要的C1单位供体,L-丝氨酸在多种生化反应中发挥重要作用,参与了嘌呤、嘧啶等多种腺苷类、核苷酸类化合物的生物合成[4-5]。研究表明,L-丝氨酸还参与体内多种生理活动,包括调节中枢神经系统发育,控制细胞增殖,促进免疫细胞的生长和功能等,在生物体内发挥重要的生理功能,是维持生物体正常生理活动不可或缺的重要氨基酸之一[3,5-6]。鉴于L-丝氨酸重要的生理作用,L-丝氨酸及其衍生物在医药领域应用广泛。L-丝氨酸是第三代氨基酸输液剂的成分之一,可以缓解大脑损伤,提高大脑机能,其衍生物磷脂酰丝氨酸可延长神经递质活力,治疗老年痴呆和记忆受损等症状[7]。此外,L-丝氨酸被开发作为营养补充剂和食品添加剂,增加食品风味和提高营养水平。L-丝氨酸具有较高的保湿性,还被应用于多种高级化妆品中,维持皮肤角质层的水分[8]。近年来,随着对L-丝氨酸生理功能研究的不断深入,多种下游应用产品持续开发,L-丝氨酸需求量不断增大,市场规模持续提升。

目前,L-丝氨酸主要通过蛋白水解法、化学合成法以及酶催化法进行生产[1,8-9]。然而上述方法存在生产成本高、产物转化率低以及环境污染等问题,严重限制了L-丝氨酸的生产规模和市场应用。相比之下,微生物发酵法具有环境友好,底物可再生,生产周期短以及过程条件温和等优势,是生产L-丝氨酸的理想方法[10-11]。近年来,研究人员在改造微生物发酵生产L-丝氨酸方面开展了大量的研究工作,随着合成生物学的发展,多种微生物代谢工程技术被应用于L-丝氨酸工程菌种的选育和改造过程中,以获得最优的生产菌种[1-2]。在此过程中需要对大量的菌种进行评估,存在大量的L-丝氨酸分析和检测工作。目前常用的L-丝氨酸检测方法主要有化学检测法(包括变色酸-分光光度法、纸层析-分光光度法、茚三酮显色法等)和高效液相色谱法[12]。然而化学检测法通常存在灵敏度差、准确度低、步骤繁琐等问题,尤其是在发酵液中组分复杂的情况下高效检测L-丝氨酸较为困难,而高效液相色谱法(HPLC)存在检测时间长、效率低等问题,对于样品多、工作量大的L-丝氨酸生产菌的高通量筛选并不适用。基于上述问题,本研究建立了一种基于酶催化的L-丝氨酸快速检测方法,通过酶特异性催化将L-丝氨酸浓度与NADPH生产速率关联,实现L-丝氨酸的高效快速检测。该方法具有检测速度快、特异性强、检测通量高等优点,为L-丝氨酸工程菌种的高通量筛选和评估提供了重要的工具方法。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 菌株和质粒

大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α由本实验室保藏,用于本实验中质粒构建。E.coli BL21(DE3)用于蛋白表达。大肠杆菌表达质粒pET21b由本实验室保藏,主要用于目的蛋白的表达与纯化。

1.1.2 试剂

L-丝氨酸(L-ser)、甘氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、丙氨酸、缬氨酸、天冬氨酸、谷氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、蛋氨酸、酪氨酸、色氨酸、脯氨酸等氨基酸,北京索莱宝生物科技有限公司。烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+),上海源叶生物试剂有限公司。

1.1.3 培养基和溶液

LB培养基(g/L):酵母粉5.0,胰蛋白胨10.0,NaCl 10.0;细胞裂解缓冲液:20 mmol/L Na2HPO4,200 mmol/L NaCl,pH 7.5;洗杂缓冲液:20 mmol/L Na2HPO4,200 mmol/L NaCl,20 mmol/L咪唑,pH 7.5;洗脱缓冲液:20 mmol/L Na2HPO4,200 mmol/L NaCl,500 mmol/L咪唑,pH 7.5;蛋白保存缓冲液:20 mmol/L Na2HPO4溶液,50 g/L甘油,pH 7.5。

1.2 仪器与设备

SX-700 高压灭菌锅,天美(中国)科学仪器有限公司;TC-XP-D 基因扩增仪,赛默飞世尔科技公司;HPX-9082MBE 恒温培养箱,上海一恒科学仪器有限公司;H2O3-100C 加热制冷型金属浴,卡尤迪生物科技有限公司;JY-SCZ2+ 蛋白电泳仪,北京君意东方电泳设备;5810R 台式冷冻离心机,德国Eppendorf公司;DK-8D 水浴锅,上海一恒仪器;Scientz-IID 超声破碎仪,宁波新芝公司;Synergy neo2 SMHTS 多功能酶标仪,美国伯腾仪器有限公司;Agilent 1260 高效液相色谱仪,美国Agilent公司;ME204 天平,Mettler Toledo;Mettler Toledo 高速振荡培养摇床,江苏新春兰科学仪器有限公司。

1.3 实验方法

1.3.1 质粒构建

来源于铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)和蚕豆农杆菌(Agrobacterium fabrum)的丝氨酸脱氢酶(L-serine dehydrogenase,SerDH)编码基因(UniProt:Q9I5I6和Q8U8I2)由金斯瑞生物科技公司合成。使用Thermo Scientific® Phusion超保真DNA聚合酶,以合成基因为模板,分别使用引物对Afsdh-F:TATACATATGAGCGGCACCATTCTGATTAC/Afsdh-R:GTGC-TCGAGGCTTTCGCGATACACTTGAAAGC,和Pasdh-F:CATATGAAACAGATTGCGTTTATTG/Pasdh-R:CTCGAG-CTGACCTTGGGTCGGATCAAAC,通过PCR获得AFSerDH和PASerDH的基因片段。然后利用限制性内切酶Nde Ⅰ和Xho Ⅰ将目的基因片段连接至pET21b上,转化至E.coli DH5α感受态细胞中,在含有100 μg/mL氨苄青霉素的LB平板上培养。通过菌落PCR方法验证,将构建正确的质粒转化至E.coli BL21感受态细胞中,分别获得重组菌E.coli BL21-AFSerDH和E.coli BL21-PASerDH。

1.3.2 蛋白表达和纯化

从-80 ℃冰箱冻存甘油管中取菌液,接种于含有100 μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基中,37 ℃过夜培养。将过夜培养的重组菌按照1%(体积分数)的接种量转接至LB液体培养基中,在37 ℃、200 r/min条件下培养,当菌液OD600值达到0.6~0.8后,加入终浓度0.4 mmol/L IPTG,16 ℃、200 r/min条件下继续培养20 h。随后在4 ℃、6 000 r/min条件下离心收集菌体,使用裂解缓冲液重悬菌体后,超声处理20 min,离心收集上清液为粗酶液。

本研究采用镍柱亲和层析法对目标蛋白进行纯化。将收集的上清液上样到Ni-NTA亲和层析柱中,使用洗杂缓冲液洗出杂蛋白后,使用洗脱缓冲液洗脱含有HIS标签的目标蛋白,使用Milipore Amicon Ultra 15超滤管对目标蛋白浓缩后,贮存在保存缓冲液中,分装后存于-80 ℃冰箱中。对获得的粗蛋白和纯化蛋白使用SDS-PAGE进行检测分析。

1.3.3 L-丝氨酸-3-脱氢酶活性测定

L-丝氨酸在L-丝氨酸-3-脱氢酶的作用下偶联NAD(P)+氧化生成NAD(P)H。因此本研究以反应过程中NADPH的生成速率来检测L-丝氨酸-3-脱氢酶的活性。酶催化反应体系为50 mmol/L Tris-HCl(pH=8.0),10 mmol/L L-丝氨酸,1 mmol/L NAD(P)+,0.5 μg酶,反应体系为200 μL,37 ℃下孵育20 min,在酶标仪下测定340 nm处的吸光度变化值。酶活性单位定义:每分钟催化生成1 μmol/L NADPH所需的酶量为1个酶活性单位(1 U)。在此条件下,分别对AFSerDH的最适温度、最适pH和动力学常数进行了测定。

1.3.4 AFSerDH催化底物特异性测定

将丝氨酸、甘氨酸、苏氨酸、半胱氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、谷氨酸、赖氨酸、精氨酸、组氨酸、蛋氨酸、酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸等20种氨基酸配制成浓度为10 mmol/L的溶液。利用AFSerDH分别对上述20种氨基酸进行酶催化测试分析,反应体系为:50 mmol/L碳酸钠-碳酸氢钠(pH=9.5),2 mmol/L NADP+,10 mmol/L L-丝氨酸,AFSerDH纯化酶。在40 ℃条件下反应20 min,利用酶标仪测定340 nm处吸光度的变化。为验证AFSerDH对L-丝氨酸催化的特异性,本研究将上述20种氨基酸进行等量混合,比较分析AFSerDH对混合溶液和L-丝氨酸标准液的酶活性。

1.3.5 标准曲线制定和加标回收实验

配制终浓度为2、4、6、8、10 mmol/L的L-丝氨酸标准液,按照优化的L-丝氨酸反应条件,测定不同浓度L-丝氨酸标准液在340 nm处吸光度的变化值,以不加L-丝氨酸的反应体系为对照组。随后以L-丝氨酸浓度为横坐标,以340 nm处吸光度的变化值为纵坐标,绘制回归曲线。

L-丝氨酸发酵液,利用HPLC法和酶法分别测定其中L-丝氨酸的含量。向发酵液中加入不同浓度的L-丝氨酸,随后利用酶法测定混合液中L-丝氨酸的含量,比较分析对照样本和回归样本中L-丝氨酸的含量。

1.3.6 HPLC测定L-丝氨酸含量

本研究采用通用氨基酸检测方法分析L-丝氨酸的含量[13]。HPLC检测系统为Agilent 1260,色谱柱为Agilent ZORBAX Eclipse AAA色谱柱(4.6 mm×150 mm,5 μm)。流动相为A相:40 mmol/L磷酸二氢钠溶液(pH=7.8),B相:V(乙腈)∶V(甲醇)∶V(水)=45∶45∶10。流速:2.0 mL/min;检测波长:338 nm;柱温:40 ℃。

2 结果与分析

2.1 基于酶催化的L-丝氨酸检测方法的设计

L-丝氨酸脱氢酶催化L-丝氨酸脱氢反应,过程中涉及辅因子NAD(P)+的氧化生成NAD(P)H。因此,L-丝氨酸脱氢酶催化反应能够将L-丝氨酸浓度与NAD(P)H的生成偶联起来,NAD(P)H的生成速率与L-丝氨酸浓度呈正比[13-14]。基于上述原理,通过在340 nm吸光度条件下测定NAD(P)H的生成速率,能够直接测定L-丝氨酸的浓度。目前,存在2种类型的L-丝氨酸脱氢酶,包括L-丝氨酸-2-脱氢酶(EC 1.4.1.7)和L-丝氨酸-3-脱氢酶(EC 1.1.1.276)。其中L-丝氨酸-2-脱氢酶催化L-丝氨酸C2位氨基氧化生成羟基丙酮酸,而L-丝氨酸-3-脱氢酶催化C3位置羟基的脱氢反应生产2-氨基丙二酸半醛,随后自发分解成2-氨基乙醛和CO2[15]。需要注意的是,L-丝氨酸-2-脱氢酶催化C2位氧化脱氨反应的吉布斯自由能为ΔG=(20.6±1.7) kJ/mol,L-丝氨酸-3-脱氢酶催化C3位脱氢反应的吉布斯自由能ΔG=(-19.2±6.9) kJ/mol。相比之下,L-丝氨酸-3-脱氢酶反应具有热力学优势,对L-丝氨酸检测过程十分有利。因此,本研究选择L-丝氨酸-3-脱氢酶作为催化酶设计开发L-丝氨酸高效检测方法。L-丝氨酸-3-脱氢酶反应方程如公式(1)所示:

(1)

2.2 L-丝氨酸-3-脱氢酶的筛选与表征

基于对L-丝氨酸-3-脱氢酶催化反应分析,本研究从BRENDA数据库中选择了2个具有较高活性的L-丝氨酸-3-脱氢酶,分别为来源于P.aeruginosaL-丝氨酸-3-脱氢酶基因Pasdh(UniProt:Q9I5I6,编码基因为:PA0743,annotated as sdh)和来源于A. fabrumL-丝氨酸-3-脱氢酶Afsdh(UniProt:Q8U8I2,编码基因为:sdh)[14-15]。为鉴定和筛选最优的L-丝氨酸-3-脱氢酶候选蛋白,本研究对2个酶分别进行蛋白表达纯化和酶活测定。

将上述基因按照大肠杆菌密码子偏好性进行密码子优化。将目的基因PasdhAfsdh分别连接至pET21b表达载体上,并且在C端添加His标签用于后期纯化,构建表达载体pET21b-Pasdh和pET21b-Afsdh。将构建的质粒分别转入E.coli BL21(DE3)中,构建重组菌株BL21-AFSerDH和BL21-PASerDH,为鉴定和筛选最优的L-丝氨酸-3-脱氢酶候选蛋白,本研究对2个酶分别进行蛋白表达纯化和酶活测定。分别对AFSerDH和PASerDH进行表达纯化。SDS-PAGE分析(图1)显示,PASerDH的蛋白分子质量约为31 kDa,AFSerDH的蛋白分子质量为27 kDa,与预期结果基本一致。而且SDS-PAGE表明,PASerDH和AFSerDH均具有良好的蛋白表达水平,其中AFSerDH比PASerDH具有更多的蛋白表达量,更适用于大规模蛋白表达和生产。

泳道1-PASerDH破碎上清液;泳道2-PASerDH纯化酶; 泳道3- Protein ladder marker;泳道4-AFSerDH破碎上清液; 泳道5-AFSerDH纯化酶。

图1 SDS-PAGE检测分析

Fig.1 SDS-PAGE analysis

随后本研究对PASerDH和AFSerDH的酶催化特性进行了研究,比较分析了2个酶分别以NAD+和NADP+为辅因子条件下的催化活性。酶催化体系为:

50 mmol/L Tris-HCl(pH=8.5),2 mmol/L NAD(P)+,0.5 μg纯化酶,10 mmol/L L-丝氨酸,37 ℃条件下孵育20 min后,在340 nm波长下检测吸光度的变化。结果如图2所示,PASerDH对辅因子NAD+比NADP+具有更高偏好性,在2 mmol/L NAD+条件下其活性达到1.49 U/mg,而在NADP+条件下其活性仅为0.21 U/mg。有趣的是,AFSerDH呈现出与PASerDH完全相反的辅因子偏好性,AFSerDH在2 mmol/L NADP+条件下其活性达到6.93 U/mg,而在NAD+条件下则无活性,说明AFSerDH对辅因子NADP+的偏好性较为严谨。随后本研究通过序列比对分析发现,PASerDH和AFSerDH具有较低的序列相似性,而且PASerDH表现出NAD(P)+辅因子保守性结合位点(GXGXXG)(图3),而AFSerDH则未找出相应的结合位点,其催化机制需进一步探究。需要注意的是,AFSerDH的酶活性是PASerDH酶活性的4.65倍,表现出更高L-丝氨酸的催化效率,是开发L-丝氨酸检测方法的理想候选酶。因此,本研究选择AFSerDH进行下一步研究。

图2 不同L-丝氨酸-3-脱氢酶催化特性的比较分析

Fig.2 Comparative analysis of catalytic properties of different L-serine-3-dehydrogenases

图3 L-丝氨酸-3-脱氢酶序列比对分析

Fig.3 Sequence alignment of L-serine-3-dehydrogenase

注:PcserDH来源于Pyrobaculum calidifontis;TTSerDH来源于Thermus thermophilus。黄色框线代表辅因子结合位点。

2.3 AFSerDH酶学性质测定

2.3.1 AFSerDH最适pH研究

为进一步探究AFSerDH的催化特性,本研究研究了pH、温度和金属离子对AFSerDH催化活性的影响。在2 mmol/L NADP+,10 mmol/L L-丝氨酸条件下,分别测定AFSerDH在不同pH(6.5、7、7.5、8、8.5、9、9.5、10、10.5、11)条件下的酶活性。选择不同pH缓冲体系的缓冲液,在pH=6.5~8时,使用50 mmol/L的3-吗啉丙磺酸(3-morpholine propanesulfonic acid,3-MOPS)进行测定;在pH=8~9.5时,使用50 mmol/L的三羟甲基氨基甲烷盐酸盐(Tris-HCl);在pH=9.5~10.5时,使用50 mmol/L的碳酸钠-碳酸氢钠溶液进行测定。结果如图4-A所示,AFSerDH在酸性和中性pH条件下具有较低的催化活性,随着pH的升高,其催化活性逐渐升高,在pH=9.5条件下,其酶活性达到最高9.8 U/mg。但是随后pH继续升高,其酶活性急剧下降。结果表明,AFSerDH在pH值为9.5条件下表现出最适的催化活性。

A-pH对AFSerDH酶活性的影响;B-温度对AFSerDH酶活性的影响;C-金属离子对AFSerDH酶活性的影响;D-保存时间对AFSerDH酶活性的影响

图4 AFSerDH酶学性质测定

Fig.4 Enzymatic characterization of AFSerDH

2.3.2 AFSerDH最适温度研究

随后本研究进一步探究了温度对AFSerDH催化活性的影响。在pH 9.5最适条件下,分别测定了AFSerDH在不同温度25、30、35、37、40、45 ℃条件下酶活性。结果如图4-B所示,重组酶AFSerDH在25~40 ℃条件下,酶活性随着温度的升高逐渐提高,在40 ℃条件下酶活性达到最高为11.3 U/mg,随后随着温度的进一步提高,其活性急剧下降。由于L-丝氨酸检测体系需要较高的酶催化活性,因此确定催化体系的最适条件参数为pH 9.5和40 ℃。

2.3.3 金属离子对AFSerDH酶活性的影响

在发酵液中通常存在大量的微量金属离子,因此本研究探究了不同金属离子对AFSerDH催化活性的影响。结果表明,在存在1 mmol/L常见金属离子K+、Na+、Zn2+、Cu2+、Co2+、Ni2+、Fe2+、Mg2+条件下,AFSerDH的酶活性几乎不受影响,仍能保持较高的催化活性(图4-C)。结果说明AFSerDH能够有效拮抗金属离子的影响,适用于分析复杂发酵液环境中L-丝氨酸的含量。

2.3.4 保存时间对AFSerDH酶活性的影响

除了酶活性外,酶的稳定性也是影响检测体系的重要因素。因此本研究探究了保存时间对AFSerDH酶活性的影响。将纯化后的AFSerDH保存于-80 ℃ 冰箱中,分别将保存时间为1、10、20、30 d的酶进行活性测定。结果表明保存1、10、20、30 d的比酶活为11.2、10.8、11.1、10.5 U/mg(图4-D)。结果表明AFSerDH具有良好的稳定性,在-80 ℃条件下保存30 d后仍能保持较高的催化活性,能够实现L-丝氨酸样品的长时间连续检测。

2.3.5 AFSerDH酶动力学常数测定

本研究对AFSerDH的动力学常数进行了分析测试。在最适pH和最适催化温度条件下(pH 9.5,40 ℃),分别测定了AFSerDH在不同底物L-丝氨酸浓度(0~400 mmol/L)和不同辅因子NADP+浓度条件的酶活性,计算AFSerDH对底物L-丝氨酸和NADP+KmVmax。结果如图5所示,在过量辅因子NADP+浓度条件下,AFSerDH对底物L-丝氨酸的Km为11.57 mmol,Vmax为14.99 U/mg,kcat为565.6 min-1,而在过量底物L-丝氨酸条件下,AFSerDH对NADP+Km为0.99 mmol,Vmax为15.91 U/mg,kcat为558.7 min-1

A-AFSerDH对L-丝氨酸的催化动力学常数测定; B-AFSerDH对NADP+的催化动力学常数测定

图5 AFSerDH对不同底物的酶动力学常数测定

Fig.5 Determination of kinetic constants of AFSerDH toward different substrates

2.3.6 AFSerDH催化底物特异性分析

底物特异性是影响检测方法开发与应用的关键指标。因此,本研究对AFSerDH催化底物特异性进行了分析,检测AFSerDH对20种氨基酸底物的催化活性。结果如图6-A所示,AFSerDH在20种氨基酸底物测试中,仅对L-丝氨酸表现出较高的酶活性,而对其他氨基酸均未表现出活性。结果表明AFSerDH对底物L-丝氨酸具有十分严谨的选择性。为进一步探究L-丝氨酸的催化反应是否受到其他氨基酸的影响,本研究在10 mmol/L的L-丝氨酸溶液中加入等量的20种氨基酸,检测AFSerDH对混合氨基酸的催化活性,以等浓度的L-丝氨酸标准液为对照,检测10 min内340 nm处吸光度的变化情况。结果如图6-B所示,混合氨基酸溶液底物在340 nm处的吸光度升高值与对照组基本一致,说明AFSerDH催化反应具有良好的特异性和稳定性,不受到其他氨基酸的干扰,能够满足复杂环境中L-丝氨酸的高效检测。

A-AFSerDH对不同氨基酸的催化活性;B-AFSerDH对 氨基酸混合液的催化活性

图6 AFSerDH催化底物特异性分析

Fig.6 Substrate specificity analysis of AFSerDH

2.4 基于酶催化的L-丝氨酸检测方法的建立和优化

2.4.1 AFSerDH酶浓度优化

AFSerDH酶量是影响反应速率的关键因素。在L-丝氨酸检测体系中,AFSerDH需要保持过量水平,以保证L-丝氨酸浓度与酶活性的相关性。因此本研究对L-丝氨酸反应体系中AFSerDH的酶浓度进行了测试优化。酶催化体系为:50 mmol/L碳酸钠-碳酸氢钠(pH值=9.5),1 mmol/L NADP+,10 mmol/L L-丝氨酸,AFSerDH纯化酶。在40 ℃条件下反应20 min,测定340 nm处吸光度的变化。结果如图7所示,在0.5~2 U/mL时,反应速率随着酶量的增加而增大,当酶量达到2 U/mL时,反应速率达到最大。同时再增加酶量,反应速率不再增加。因此确定在10 mmol/L L-丝氨酸条件下,AFSerDH的浓度为2 U/mL。

图7 L-丝氨酸检测标准曲线

Fig.7 L-serine detection standard curve

A-AFSerDH酶浓度优化;B-NADP+浓度优化

图7 基于酶催化的L-丝氨酸检测方法的建立和优化

Fig.7 Establishment and optimization of an enzyme-catalyzed detection method for L-serine

2.4.2 NADP+浓度优化

辅因子NADP+的浓度是影响L-丝氨酸反应速率的另一个关键因素。在L-丝氨酸检测体系中,NADP+的浓度也应保持过量水平,从而使AFSerDH的酶活性只与L-丝氨酸的浓度正相关。因此本研究对反应体系中NADP+的浓度进行了优化。在2.4.1节所述反应体积条件下,向L-丝氨酸反应体系中加入终浓度为1、2、3、4、5、6 mmol/L的NADP+,测定AFSerDH的酶活性。结果如图7所示,AFSerDH催化活性随着NADP+浓度的升高而升高,当NADP+浓度达到3 mmol/L,反应速率达到最大。因此选择L-丝氨酸反应体系中NADP+的最佳浓度为3 mmol/L。

2.4.3 基于酶催化的L-丝氨酸检测方法的建立和标准曲线绘制

基于对AFSerDH催化体系的优化,本研究建立了L-丝氨酸酶法检测方法。该方法使用的催化体系为:50 mmol/L碳酸钠-碳酸氢钠(pH=9.5),3 mmol/L NADP+,AFSerDH 2 U/mL,检测温度为40 ℃,反应时间为20 min,使用分光光度计或酶标仪测定340 nm 处吸光度的变化。随后利用L-丝氨酸标准液,配制浓度为0~10 mmol/L的L-丝氨酸,分别测定不同样品中的L-丝氨酸含量。结果表明,L-丝氨酸浓度为0~10 mmol/L时340 nm处吸光度的上升值(ΔOD340nm)与L-丝氨酸浓度呈良好的线性关系,标准曲线的回归方程为Y=0.102 4X+0.029 9,R2=0.996 5(图8)。结果说明,本研究建立的基于酶催化的L-丝氨酸检测方法在0~10 mmol/L检测阈值范围内,具有较高的检测灵敏度和准确性,适用于L-丝氨酸的高效快速检测。

2.5 L-丝氨酸检测方法的回收率测定

为了进一步验证基于酶催化的L-丝氨酸检测方法在实际生产过程的应用,本研究利用L-丝氨酸检测方法对L-丝氨酸发酵液中L-丝氨酸的含量和加标回收率进行了测定(表1)。在L-丝氨酸发酵液中加入终质量浓度为10、20、30 g/L的L-丝氨酸标准液,混匀后利用L-丝氨酸酶催化检测方法对混合液中的L-丝氨酸含量进行测定,以HPLC法为对照。结果表明,HPLC法和酶法检测的L-丝氨酸发酵液中的L-丝氨酸含量分别为16.5、16.9 g/L,结果基本一致。通过加标回收实验分析,L-丝氨酸酶法检测方法的平均回收率达到102.03%。综上所述,本研究建立的L-丝氨酸酶催化检测方法具有良好的准确性,能有效测定发酵液中L-丝氨酸的含量,能够满足实际生产过程中L-丝氨酸含量的快速检测分析。

表1 发酵液中L-丝氨酸回收率测定

Table 1 Determination of L-serine recovery in fermentation broth

3 结论

本研究针对目前L-丝氨酸检测方法灵敏性低、特异性差、操作复杂等问题,利用L-丝氨酸-3-脱氢酶的催化特性,将L-丝氨酸浓度和NADPH生成量偶联,建立了一种简单快速的L-丝氨酸酶法检测方法,实现了L-丝氨酸样品浓度的高效快速检测。本研究通过对AFSerDH酶学性质的分析和催化体系的优化,建立了L-丝氨酸酶法检测体系,该体系包括50 mmol/L碳酸钠-碳酸氢钠缓冲液(pH=9.5),3 mmol/L NADP+,AFSerDH 2 U/mL,检测温度为40 ℃,检测L-丝氨酸的浓度为1~10 mmol/L。本研究建立的L-丝氨酸酶法检测方法具有简单快速、专一性强、检测效率高等特点,能够在较短时间内完成大量L-丝氨酸浓度的检测工作,从而实现L-丝氨酸工程菌种的高通量检测和评估,为L-丝氨酸工业菌种的高通量选育提供了重要的技术支撑。

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Development and optimization of a novel enzyme-catalyzed reaction-based detection method for L-serine

SUN Mujiao1,2, JU Jiansong1*, LIU Jun2, WEI Liang2*

1(College of Life Sciences, Hebei Normal University, Shijiazhuang 050024, China) 2(Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China)

ABSTRACT L-Serine is an important non-essential amino acid with significant physiological functions, which has been widely applied in the food, cosmetics, and pharmaceutical industries.Microbial fermentation offers advantages such as environmental friendliness, mild reaction conditions, and renewable substrates, making it an ideal method for L-serine production and attracting considerable research interest.During the screening and engineering of L-serine-producing strains, it is necessary to evaluate a large number of microbial variants, which requires extensive L-serine analysis and detection.However, current detection methods for L-serine suffer from limitations such as low sensitivity, poor accuracy, and complicated procedures, which severely restrict the efficiency of high-throughput and rapid assessment of L-serine samples. To address these challenges, this study developed a simple, rapid, and highly specific detection method for L-serine based on the catalytic characteristics of L-serine-3-dehydrogenase.By exploring and analyzing the enzymatic properties of L-serine-3-dehydrogenase, an optimized enzymatic detection system for L-serine was established.This system consisted of 50 mmol/L sodium carbonate-sodium bicarbonate buffer (pH=9.5), 3 mmol/L NADP+, and AFSerDH enzyme at a concentration of 2 U/mL, with an optimal detection temperature of 40 ℃.The developed enzymatic detection method was characterized by its simplicity, rapid operation, and high detection efficiency.It demonstrated a good linear relationship within the L-serine concentration range of 1-10 mmol/L, with an R2 value of 0.996 5.This enzyme-based detection method enables high-throughput detection and evaluation of L-serine samples, providing crucial technical support for the efficient screening of industrial L-serine-producing strains.

Key words L-serine; L-serine-3-dehydrogenase; enzymatic property analysis; high-throughput detection method

第一作者:硕士研究生(魏亮副研究员和鞠建松教授为共同通信作者,E-mail:weil@tib.cas.cn;jujiansong@126.com)

基金项目:天津市合成生物技术创新能力提升行动项目(TSBICIP-KJGG-026)

收稿日期:2025-03-03,改回日期:2025-07-28

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.042582

引用格式:孙慕娇,鞠建松,刘君,等.基于酶催化的新型L-丝氨酸检测方法的开发与优化[J].食品与发酵工业,2026,52(4):353-360.SUN Mujiao,JU Jiansong,LIU Jun, et al.Development and optimization of a novel enzyme-catalyzed reaction-based detection method for L-serine[J].Food and Fermentation Industries,2026,52(4):353-360.