产Surfactin芽孢杆菌的筛选及特性研究

李彦林1,2,张蔚1,2,李晓玉1,2,鲁心怡1,2,曹钰1,2*

1(江南大学 生物工程学院,江苏 无锡,214122) 2(教育部工业生物技术重点实验室(江南大学),江苏 无锡,214122)

摘 要 以发酵上清液表面活性的排油活性、乳化能力、表面张力为初筛参数,srfA基因为复筛指标,定向筛选产表面活性剂surfactin的菌株。通过薄层层析(thin layer chromatography,TLC)定性分析和超高效液相色谱-电喷雾四级杆飞行时间质谱(ultra performance liquid chromatography/electrospray ionization quadrupole time-of-flight high-resolution/mass spectrometry,UPLC-ESI/Q-TOF/MS)定量分析,筛选获得1株可利用啤酒糟高产surfactin的菌株41-3,鉴定为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),采用液质分析所产surfactin同系物组分。B. subtilis 41-3在MSM培养基中发酵,surfactin产量为541.32 mg/L,同系物以脂肪酸链为C14和C13的surfactin为主,两者含量约占75%。以啤酒糟酶解液作为碳源,发酵生产surfactin,产量提高1.38倍,达到746.35 mg/L。且surfactin的合成向长链脂肪酸surfactin迁移,表明其具有更强的生物表面活性。该研究结果为surfactin菌株筛选提供新的思路,为发酵生产surfactin提供了新的原料来源,为啤酒糟综合利用提供新的途径,具有应用前景。

关键词 生物表面活性剂;surfactin;枯草芽孢杆菌;啤酒糟;同系物分析

当前,全球表面活性剂的使用量大幅增加,每年化学和生物表面活性剂的全球市场价值超过200亿美元[1-2]。和化学表面活性剂相比,生物表面活性剂是微生物发酵产生的生物活性分子,具有较低的毒性和较高的生物降解性,并且能够在极端的温度、pH和盐度下保持表面活性[3]

Surfactin是由C12—C17长链脂肪酸和7个氨基酸构成的环状脂肽,为研究最多的脂肽类表面活性剂之一,具有保湿[4]、抑菌[5]、抗炎[6]、抗肿瘤[7]等活性,甚至可以辅助治疗人类免疫缺陷病[8],在化妆品、食品、医药等领域具有广阔的应用前景。但其工业化进程受制于较高的生产成本。通常在发酵类产品的生产中,原材料成本约占总成本的41%[9]。因此使用廉价的工农业废弃物作为碳源来发酵生产surfactin,在降低生产成本方面扮演重要角色。目前已有以梨汁[10]、橄榄油场废料[11-12]、木薯废水[13]、白酒糟[14]、过期糖蜜[15]、豆渣[3]作为碳源的文献报道。啤酒糟(brewer's spent grain,BSG)是在啤酒生产环节麦芽汁加工过程残留的固体物质。全球每年BSG产量约3 860万t[16],其中我国年产量约1 000万t[17],具有丰富的资源。目前BSG主要用于动物饲料[18],亟待高附加值的开发利用。

本研究主要根据surfactin的表面活性性质,以及生产菌株具备的surfactin合成调控基因srfA,开展surfactin合成菌株的定向筛选,通过薄层层析(thin layer chromatography,TLC)和超高效液相色谱-电喷雾四级杆飞行时间质谱(ultra performance liquid chromatography/electrospray ionization quadrupole time-of-flight high-resolution/mass spectrometry,UPLC-ESI/Q-TOF/MS)进行产物的定性验证和定量分析,筛选利用BSG酶解液为碳源的surfactin高产菌株,并进行分子生物学鉴定。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

无锡雪浪山附近筛选得到的247株芽孢杆菌,实验室保藏。

surfactin(≥98%)标准品S3 523,美国sigma公司;甲醇、乙腈(HPLC级),赛默飞世尔科技有限公司;三氟乙酸(HPLC级),上海麦克林生化科技有限公司;普通PCR制剂,Takara公司;其他试剂,国药集团(上海)化学试剂有限公司。

1.2 培养基

LB培养基(g/L):蛋白胨10,酵母膏5,NaCl 10。制备固体培养基时添加2%营养琼脂,pH 7.0。

MSM培养基(g/L):葡萄糖40,NH4NO3 8,KH2PO4 4.08,Na2HPO4 5.68,MgSO4·7H2O 2.46×10-2,CaCl2 1.03×10-3,FeSO4 1.11×10-3,EDTA 1.18×10-3,pH7.0。

发酵培养基:用5 g/L预处理BSG的酶解液替代MSM培养基中葡萄糖。

1.3 仪器与设备

LDZX-50KBS高压蒸汽灭菌锅,上海申安医疗机械厂;T100 PCR仪,美国Bio-Rad公司;TGL-16C高速离心机,上海安亭科学仪器厂;GSP-9050MBE隔水式电热恒温培养箱,上海博迅实业有限公司;ZQZY-70B振荡培养箱,上海知楚仪器;PA2014N电子天平,梅特勒-托利多国际贸易(上海)有限公司;SW-CJ-2FD洁净工作台,苏净安泰空气技术有限公司;DCAT21表面张力动态接触角测量仪,德国Dataphysics公司;Chromaster高效液相色谱仪,日本日立公司;MALDI SYNAPT MS超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱联用仪,美国waters公司。

1.4 方法

1.4.1 发酵上清液性质测定

基于surfactin的表面活性特性,通过无细胞发酵上清液排油活性、乳化指数及表面张力性质的测定,初步筛选产生物表面活性剂的菌株。即将筛选得到的247株芽孢杆菌接种于MSM培养基中30 ℃,200 r/min摇瓶培养96 h,发酵液于10 000 r/min离心5 min得到无细胞上清,进行性质测定。

1.4.1.1 排油活性(ODA)测定

取30 mL蒸馏水于培养皿中,加20 μL大豆油于蒸馏水表面,形成油层之后,滴加10 μL无细胞上清液,若能够形成透明圈,说明有表面活性物质产生,并记录透明圈直径大小。

1.4.1.2 乳化指数(E24)测定

以乳化指数来表征无细胞上清液的乳化能力。取2 mL大豆油于试管中,然后加入2 mL无细胞上清液,旋涡高速振荡2 min后,在室温下静置24 h,计算乳化指数E24

(1)

式中:h1,乳化层高度;h2,液体总高度。

1.4.1.3 表面张力(SFT)测定

利用德国Dataphysics公司表面张力动态接触角测量仪测定无细胞上清液表面张力。取40 mL无细胞上清液于烧杯中,放置到张力计检测品台上,按照说明书方法进行操作。测定不同样品之间需用无菌的MSM培养基进行洗涤后测定。

1.4.2 srfA基因特异PCR分析

经过发酵液性质测定,选择初步确定能产表面活性剂的菌株。进行srfA基因检测,进一步确定菌株是否具有合成surfactin合成酶的能力。PCR扩增引物及条件参照文献[19]。

1.4.3 发酵产物分析

向无细胞上清液中添加5 mol/L的HCl调节pH至2.0,放于4 ℃冰箱过夜,10 000 r/min离心5 min,弃上清,沉淀用甲醇溶解后备用。

1.4.3.1 薄层层析(TLC)

通过TLC初步半定性半定量surfactin的产生,使用Merck硅胶60荧光薄层层析铝箔板F254进行薄层层析,流动相为V(氯仿)∶V(甲醇)∶V(乙酸)=80∶10∶10,surfactin标品作为对照。

1.4.3.2 UPLC-ESI/Q-TOF MS条件

液相条件:使用Waters C18色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.7 μm);流动相A为含有体积分数为0.1%甲酸的色谱乙腈溶液,流动相B为含有体积分数为0.1%甲酸的水溶液,V(A)∶V(B)=90∶10等度洗脱;柱温30 ℃,流速为0.3 mL/min;进样体积5 μL。

质谱条件:电喷雾离子源(ESI),正离子检测模式;离子源温度为20 ℃;毛细管电压3 000 V;锥孔电压30 V;去溶剂气体流速500 L/h;去溶剂温度500 ℃;锥孔气流50 L/h;范围m/z 500~1 500,检测时间20 min。

1.4.4 surfactin定量检测

采用高效液相色谱仪对surfactin进行定量测定。色谱柱:Agilent C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,5 μm);流动相A为含有体积分数为0.1%三氟乙酸的色谱乙腈溶液,流动相B为含有体积分数为0.1%三氟乙酸水溶液,V(A)∶V(B)=90∶10等度洗脱;柱温30 ℃,流速为1 mL/min;检测波长205 nm;进样体积20 μL。

1.4.5 利用预处理BSG酶解液中发酵生产surfactin

参考文献[20]BSG酶解条件,酶解完成后,100 ℃灭酶10 min,酶解液处理方式分为2种,一种是10 000 r/min离心5 min,得到BSG酶解上清液(supernatant of enzymatic hydrolysate of BSG,SEH-BSG),另一种纱布过滤得到BSG酶解滤液(filtrate of enzymatic hydrolysate of BSG,FEH-BSG),配制发酵培养基,121 ℃灭菌20 min。按照10%接种量接入菌株,30 ℃,200 r/min培养96 h,测定surfactin产量,选出利用BSG酶解液最好的菌株。

1.4.6 发酵产物纯化及保湿性测定

发酵产物纯化方法参照文献[21],保湿性测定参照文献[22]。

1.4.7 菌株鉴定

1.4.7.1 菌株形态观察

活化菌株,挑取芽孢杆菌新鲜培养物,进行革兰氏染色和芽孢杆菌显微形态观察;同时在LB平板划线,培养观察菌落形态。

1.4.7.2 菌株16S rDNA分析

采用细菌基因组抽提盒提取芽孢杆菌总DNA,使用通用引物27F和1 492R对菌株16S rDNA进行PCR扩增,目标片段1 500 bp左右,PCR条件为:95 ℃预变性5 min,94 ℃变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,进行30个循环,72 ℃修复延伸5 min,10 ℃保温。PCR产出纯化后,由苏州金唯智生物科技有限公司进行测序。

2 结果与分析

2.1 产surfactin菌株定向筛选

2.1.1 基于发酵上清液表面活性特性的初筛

Surfactin是一种生物表面活性剂,具有表面活性剂的典型特征,即排油活性(ODA)、乳化指数(E24)和降低水表面张力(SFT),SFT值越低,表明表面活性越强,ODA与E24值越大。据此,从247株芽孢杆菌的MSM培养基发酵培养上清液中共筛选出17株同时具有上述3种特性的菌株,测定结果如图1。

图1 不同菌株发酵上清液的表面活性特性分析
Fig.1 The surface activity parameters of different strains’ fermentation supernatant

以无菌的MSM培养基为对照,发现菌株41-3发酵液降低培养基SFT值,提高培养基ODA和E24值效果最好,表明该菌株合成生物表面活性剂能力最强,有可能是surfactin高产菌株。

2.1.2 基于菌株srfA基因特异PCR的复筛

由于srfA是编码surfactin合成酶的基因,缺失srfA基因,surfactin将不能合成。具有表面活性剂典型特征的17株芽孢杆菌进行srfA基因检测,如图2所示,发现有8株芽孢杆菌srfA基因阳性,编号分别为20-2,41-3,43-3,44-3,47-3,49-5,50-1,56-2。

M-maker2000;1~17分别代表菌株9-1,19-1,34-2,41-3,20-2,43-3,44-3,15-1,44-1,47-3,49-5,51-5,46-3,68-1,50-1,56-2,60-1
图2 不同菌株srfA基因特异性PCR分析
Fig.2 Analysis of srfA gene specific PCR in different strains

2.2 利用BSG的高产菌株的选择

srfA基因检测阳性的8株芽孢杆菌接种到基础培养基中30 ℃培养96 h,经酸沉,甲醇溶解,通过TLC和UPLC-ESI/Q-TOF MS定性分析菌株的发酵产物中是否含有surfactin。通过HPLC定量测定surfactin。

2.2.1 发酵产物的定性分析

2.2.1.1 TLC法定性分析发酵产物

如图3所示,菌株41-3发酵液提取物和sigma公司surfactin标品(S3 523)经薄层层析板的条带一致,有相同的Rf值。表明发酵液中含有surfactin。故进一步进行UPLC-ESI/Q-TOF MS分析,以明确该产物是否为surfactin。

1- surfactin标品(S3 523);2-菌株41-3发酵液提取物
图3 紫外254nm波长下样品的TLC分析结果
Fig.3 TLC results of samples at UV 254 nm

2.2.1.2 菌株41-3发酵液提取物中surfactin定性分析

利用UPLC-ESI/Q-TOF MS液质连用法,对菌株41-3发酵液提取物中的surfactin进行定性分析。结果见图4。从图4可见,surfactin标品(S3 523,Sigma公司)和菌株41-3发酵提取物均为一些同系物,其[M+H]+峰均位于1 008、1 022、1 036、1 050、1 064 m/z,[M+Na]+峰均位于在m/z 1 030、1 044、1 058、1 072、1 086,分别代表C13—C17surfactin同系物。

a-surfactin标准品;b-菌株41-3发酵提取物
图4 液质联用分析样品的[M+H]+和[M+Na]+质谱图
Fig.4 Comparison of [M+H]+ and [M+Na]+ spectra of samples by LC/MS analysis

2.2.2 surfactin高产菌株的筛选

根据不同浓度的surfactin标品配置的标准溶液,绘制出surfactin标准曲线。得到surfactin浓度与峰面积的对应关系:

Y=2×10-5X峰面积-0.966 7,R2=0.999 1

(2)

式中:Y,surfactin浓度质量浓度,g/L;X,峰面积。

对8株产surfactin的菌株以MSM培养30 ℃,200 r/min发酵96 h,HPLC测定其产量,结果见图5。其中菌株41-3 surfactin产量最高,达到541.32 mg/L。其次为菌株43-3,其surfactin产量达到258.39 mg/L,其余菌株发酵产量均不到100 mg/L。据文献报道,通常天然分离的芽孢杆菌surfactin产量为100 mg/L左右,而菌株41-3 surfactin产量达到541.32 mg/L,故选用菌株41-3作进一步研究。

图5 不同菌株在MSM中surfactin产量
Fig.5 Surfactin production of different strains in MSM

2.2.3 利用BSG产surfactin菌株surfactin产量及同系物成分分析

2.2.3.1 利用BSG产surfactin菌株surfactin产量

为考察菌株对BSG的发酵利用情况,采用10 g/L的NaOH稀碱溶液预处理BSG,去除木质素便于纤维素酶更好地水解纤维素,以酶解液中的还原糖供菌株生长和发酵并生产surfactin。选取菌株在MSM培养基中surfactin产量最高的菌株41-3和43-3,进行BSG发酵试验,结果见表1。

表1 菌株利用BSG酶解液发酵试验
Table 1 Fermentation results by using BSG enzymatic hydrolysate

菌株酶解液处理方式生物量×10-7/(CFU·mL-1)surfactin产量/(mg·L-1)MSM培养1.85±0.09541.32±17.4341-3SHE-BSG1.67±0.38506.39±21.31FEH-BSG7.15±0.15746.35±18.95MSM培养1.90±0.33258.39±6.9743-3SHE-BSG1.54±0.22231.48±14.78FEH-BSG5.85±0.23301.81±20.53

从表1中看出,相比于MSM培养基,菌株41-3和43-3在SHE-BSG酶解液(无固形物)中培养,surfactin产量分别下降了34.93 mg/L、26.89 mg/L。然而,菌株41-3和43-3在FEH-BSG酶解液(含固形物)中培养,surfactin产量相比于MSM培养基均有提高,特别是菌株41-3 surfactin产量达到746.35 mg/L,提高了1.38倍,同时生物量和MSM培养基培养相比,也从1.85×107 CFU/mL提高到7.15×107 CFU/mL。可能原因是BSG酶解完成后,FEH-BSG酶解液含有固体BSG颗粒,而且有报道称,固体物质能够使菌体吸附,提高生物量,进而提高surfactin产量[23]

2.2.3.2 不同碳源条件下发酵产物中surfactin同系物分析

根据UPLC-ESI/Q-TOF MS样品出峰时间和质荷比对应关系,对发酵产物中的surfactin各同系物的相对含量进行分析,结果见表2。

表2 利用不同碳源发酵产的surfactin同系物分析
Table 2 Analysis of surfactin homologues produced by fermented with different carbon sources

碳源同系物[M+H]+C12C13C14C15C169941 0081 0221 0361 050葡萄糖14.81±1.0134.99±0.8642.67±1.383.97±0.043.57±0.05FEH-BSG酶解液12.93±0.7331.45±1.2844.43±0.855.33±0.125.86±0.09

从表2可以看出,菌株41-3产生的surfactin同系物中,以脂肪酸链为C14和C13的surfactin为主,两者含量约占75%。利用FEH-BSG酶解液和利用葡萄糖发酵生产surfactin相比,surfactin的合成向更长链脂肪酸surfactin迁移。有文献报道,surfactin的表面活性会随着脂肪酸链的增长而显著提高,同时其乳化,保湿性能也有所增强[24-25]。分别以FEH-BSG酶解液和葡萄糖为碳源发酵,对获得的surfactin进行表面活性特性分析,结果见表3。利用前者生产的surfactin同系物的表面张力、乳化指数以及保湿性均优于后者,其中,表面张力降低了6.31%,乳化指数和保湿性分别提高了7.53%和48.04%。因此,FEH-BSG酶解液作为碳源时不仅提高了surfactin产量,也增强了surfactin的表面活性性能,可以作为葡萄糖的替代品用来发酵生产surfactin。

表3 利用不同碳源发酵产的surfactin表面活性分析
Table 3 Surface activity analysis of surfactin produced by fermented with different carbon sources

碳源表面张力/(mN·m-1)乳化指数/%保湿性/%葡萄糖28.98±0.0368.52±0.13-7.64±0.25FEH-BSG酶解液27.15±0.0273.68±0.05-3.97±0.19

2.2.4 高产surfactin菌株鉴定

2.2.4.1 菌株41-3形态观察

菌株41-3为革兰氏阳性菌,菌落易挑起,呈白色,表面粗糙不透明。菌体细胞呈杆状,能够形成芽孢,芽孢呈椭圆状,位于细胞中央。图6-a为菌株平板形态,图6-b为菌株细胞革兰氏染色后油镜下的显微镜形态。

a-平板菌落形态;b-细胞显微形态
图6 菌株41-3平板菌落形态和细胞显微形态
Fig.6 Colony morphology and cell microscopic morphology of strain 41-3

2.2.4.2 菌株41-3分子生物学鉴定

以通用引物27F和1 492R对41-3菌株16s rDNA进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,得到大约为1 500 bp的条带,如图7。

1- DNA分子标记;2- PCR产物
图7 菌株41-3 16S rDNA的PCR结果
Fig.7 16S rDNA PCR results of strain 41-3

PCR产物经纯化后,送样测序,经过NCBI数据库BLAST序列进行同源性比对,发现41-3菌株与Bacillus subtilis具有99%的同源性,亲缘关系最近,由此可确定菌株41-3菌株为Bacillus subtilis(枯草芽孢杆菌)。在NCBI数据库中下载相似度高的序列,利用MEG6软件构建进化树,如图8。

图8 菌株41-3进化树
Fig.8 The phylogenetic tree of strain 41-3

3 结论

Surfactin是目前发现的最有效的生物表面活性剂,但生产成本过高限制了其工业化生产,筛选高产surfactin生产菌株及降低生产原料成本势在必行。

本研究根据surfactin性质及其编码基因,通过TLC和UPLC-ESI/Q-TOF MS定性定量分析,筛选分离得到1株surfactin产量较高的菌株41-3。经过形态学观察和16S rDNA分子生物学实验,菌株41-3为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。另外,在MSM培养基中,枯草芽孢杆菌41-3surfactin产量为541.32 mg/L。然而,使用BSG酶解液作为碳源发酵生产surfactin,surfactin产量提高了1.38倍,达到746.35 mg/L。经过同系物分析比较,以BSG酶解液为碳源生产surfactin,长脂肪链的同系物含量提高,意味着BSG不仅仅可以作为碳源生产surfactin,而且surfactin的生物活性也随着长脂肪链的同系物含量提高而增强。

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Screening and characteristics of surfactin-producing Bacillus

LI Yanlin1,2, ZHANG Wei1,2, LI Xiaoyu1,2, LU Xinyi1,2, CAO Yu1,2*

1(School of Biotechnology, Jiangnan University, Wuxi 214122, China)2(The Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education(Jiangnan University), Wuxi 214122, China)

Abstract The surfactin producing strains were screened directionally using oil repellency, emulsifying ability and surface tension of the fermentation supernatant surfactant as preliminary screening parameters, and srfA gene for rescreening. A surfactin high-yield strain 41-3 utilizing brewer's spent grain (BSG) was screened by thin layer chromatography (TLC) qualitative analysis and ultra-performance liquid chromatography/electrospray ionization quadrupole time-of-flight high-resolution/mass spectrometry (UPLC-ESI/Q-TOF MS) quantitative analysis. The strain was identified as Bacillus subtilis, and different congeners of surfactin were analyzed. The surfactin yield of B. subtilis 41-3 was 541.32 mg/L in MSM medium, and C14 and C13 fatty-acid-chain surfactins were the two most abundant homologues, which accounted for 75% of total surfactin. When BSG was used as fermentation substrate, the yield of surfactin increased 1.38 times to 746.35 mg/L, and the surfactin synthesis shifted to long fatty-acid-chain surfactins, which indicated better biosurface activity. This study provides new ideas for surfactin-producing strain screening and new raw materials for surfactin production, as well as revealing a new way for comprehensive utilization of BSG.

Key words bio-surfactant; surfactin; Bacillus subtilis; brewer's spent grain; homologue analysis

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.019918

第一作者:硕士研究生(曹钰副教授为通讯作者,E-mail: tsaoy5@jiangnan.edu.cn)。

基金项目:高等学校学科创新引智计划(111计划)资助项目(111-2-06);江苏高等优势学科建设工程资助项目(PAPD);江苏省现代工业发酵协同创新中心资助项目;江苏高校品牌专业建设工程资助项目(TAPP)

收稿日期:2019-01-10,改回日期:2019-04-02