昆虫来源L-天冬氨酸-α-脱羧酶突变体的酶学性质表征

叶文琪,薛岚,王超,崔文璟,周哲敏,刘中美*

(江南大学 生物工程学院,江苏 无锡,214122)

摘 要 选取突变体K49R进行分离纯化、酶学性质表征,并进行全细胞催化合成β-丙氨酸,旨在研究红粉甲虫来源的L-天冬氨酸-α-脱羧酶(L-aspartate-α-decarboxylase,ADC)的酶学性质,并为生物法制备β-丙氨酸提供理论与技术支持。突变体K49R最适pH为6.5,在pH 6.0~7.0之间保持稳定;最适温度为42 ℃,热稳定性较野生型提高1.7倍;底物亲和力大幅提高,催化效率是野生型的1.8倍。在培养基中添加10 g/L葡萄糖可以有效提高重组菌的生物量,以及重组酶的可溶性表达量;在全细胞催化合成β-丙氨酸体系中,添加磷酸吡哆醛(pyridoxal-5-phosphate,PLP)可以缩短反应时间,提高催化效率。该研究开发了具有工业化潜力的工程菌,建立了绿色、高效的β-丙氨酸生物合成法,为β-丙氨酸生物合成的产业化奠定了重要基础。

关键词 β-丙氨酸;L-天冬氨酸-α-脱羧酶;红粉甲虫;热稳定性;全细胞催化

β-丙氨酸(3-氨基丙酸)广泛应用于医药、食品、化工等领域,目前主要是以丙烯腈或β-氨基丙腈为底物通过化学合成[1-2]。随着环境问题日益引起人们的关注,传统的化学方法将逐渐被生物方法所取代,如酶转化法、全细胞催化法和发酵法[3-4]

L-天冬氨酸-α-脱羧酶(EC4.1.1.11 ADC)是催化L-天冬氨酸产生β-丙氨酸的关键酶,近几十年来受到广泛的关注。细菌来源的ADC研究较多,包括来源于大肠杆菌、谷氨酸棒杆菌和枯草芽孢杆菌的ADC等[5-8]。1979年,WILLIAMSON和BROWN首次从大肠杆菌中分离出ADC[9],随后RAMJEE等[10]对该酶进行酶学性质表征,其Kmkcat分别被确定为0.151 mm和0.57 s-1。谷氨酸棒杆菌来源的ADC比酶活为2.7 μmol/(min·mg) [11]。结核分枝杆菌来源的ADC经过量表达、纯化后,测得动力学参数Kmkcal分别为0.219 mm和0.65 s-1。,比酶活为2.1 μmol/(min·mg)[12]

谷氨酸棒杆菌来源的ADC稳定性好、酶活较高,具有工业应用潜力。用谷氨酸棒杆菌来源的ADC纯酶合成β-丙氨酸,产量可达到12.85 g/L [13];过表达谷氨酸棒杆菌来源的ADC并设计代谢途径,β-丙氨酸合成量达到32.3 g/L [14];去年,LI等[15]构建了过量表达谷氨酸棒杆菌ADC的大肠杆菌重组菌,实施全细胞催化生产β-丙氨酸,产量达到24.8 g/L。

众多的研究表明,微生物来源ADC的酶活力很低,使得β-丙氨酸的生物合成法受到限制。有研究表明,昆虫来源ADC的酶活力远高于细菌来源ADC[16-18]。在前期研究中,将红粉甲虫(又名赤拟谷盗,Tribolium castaneum)来源的ADC在大肠杆菌中重组表达,重组酶的比酶活是细菌来源的2倍左右[19]。对其进行分子改造,初筛结果显示突变体K49R稳定性与酶活力较野生型有一定的优势[20]。本研究旨在实现β-丙氨酸“绿色生产”,筛选催化能力优良的突变体、并进行酶学性质表征,建立全细胞催化策略,优化重组菌株合成β-丙氨酸的催化工艺。

1 材料与方法

1.1 材料

重组表达载体pEt-28a(+)-TcADC、pEt-28a(+)-TcADC/K49R为本实验室早期构建,宿主菌E. coli BL21(DE3)为实验室保藏。种子培养基为LB培养基,诱导培养基为2YT培养基。L-天冬氨酸钠、β-丙氨酸、IPTG、卡那霉素购于上海生工生物工程有限公司;酵母提取物、蛋白胨购于Oxford公司;异硫氰酸苯酯(phenyl isothiocyanate,PITC)购于Sigma公司。

1.2 主要仪器设备

蛋白纯化仪和纯化柱,GE Healthcare UK Ltd。

2 实验方法

2.1 酶的过量表达与纯化

将重组大肠杆菌BL21/pET28a-TcADC、BL21/pET28a-TcADC/K49R的单克隆接种于5 mL LB培养基(含有50 μg/mL卡那霉素)中,置于37 ℃、200 r/min的摇床中,过夜振荡培养,进行菌种活化。按2%(体积分数)接种量接种于含有50 μg/mL卡那霉素的 2YT培养基中,37 ℃、200 r/min,振荡培养至OD600为0.6~0.8。加入终浓度为0.2 mmol/L的IPTG,在20℃条件下诱导表达20 h左右。

利用Purifier AKTA蛋白纯化仪和His Trap HP纯化柱对目的蛋白进行分离纯化。收集细胞培养液,12 000 r/min离心2 min,弃去上清液,收集沉淀。用Binding缓冲液(20 mmol/L Na2HPO4、20 mmol/L NaH2PO4、500 mmol/L NaCl、20 mmol/L咪唑)悬浮细胞,置于冰上进行超声波破碎。溶液澄清之后,于4 ℃、12 000 r/min离心45 min,收集细胞破碎上清液。用Binding缓冲液,将0.45 μm滤膜过滤后的粗酶液上样,用Binding缓冲液洗去非结合蛋白。用15个柱体积的Elution缓冲液(20 mmol/L Na2HPO4、20 mmol/L NaH2PO4、500 mmol/L NaCl、500 mmol/L咪唑)进行线性洗脱,收集洗脱峰。放入50 mmol/L Tris-HCl(pH 7.0)缓冲液中,4 ℃,过夜透析除去咪唑。利用12%(质量浓度)的SDS-PAGE对分离纯化样品进行电泳检测,利用Brandford法测定目的蛋白浓度。

2.2 L-天冬氨酸和β-丙氨酸检测

L-天冬氨酸和β-丙氨酸采用异硫氰酸苯酯(PITC)衍生法检测[19-20]。氨基酸的衍生产物采用HPLC测定,色谱柱为La Chrom C18(5 μm,4.6 mm×250 mm);流动相A溶液80%(体积分数)乙腈水溶液,B溶液97∶3(体积分数,pH 6.5)的0.1 mol/L乙酸钠-乙腈溶液;梯度洗脱:0~20 min,B溶液由95%下降至65%;20~30 min,B溶液由65%上升至95%;30~43 min,B溶液梯度保持不变,检测波长为254 nm,柱温为40 ℃。

2.3 酶学性质测定

最适温度测定。将pH 6.5的反应液(含200 μg/mL纯酶液,100 mmol/L L-天冬氨酸钠,1 mmol/L PLP)置于不同温度的水浴(30、37、40、42、50、55 ℃)中反应10 min,测定酶活。将最高酶活定义为100%,分析酶的最适反应温度。

温度稳定性测定。将500 μg/mL纯酶液置于不同温度(30、37、40、42、50、55 ℃)孵育30 min后,于冰上冷却5 min。加入终浓度100 mmol/L L-天冬氨酸钠和1 mmol/L PLP,于37 ℃,pH 6.5条件下反应10 min测定残余酶活。将初始酶活定义为100%,分析温度稳定性情况。

最适pH测定。配置不同pH 4.0、5.0、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0的反应液(含200 μg/mL纯酶液,100 mmol/L L-天冬氨酸钠,1mmol/L PLP),于37 ℃反应10 min测定酶活性。将最高酶活定义为100%,分析酶的最适反应pH。

pH稳定性测定。将500 μg/mL纯酶液置于不同pH缓冲液(pH 4.0、5.0、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0)中,于冰上过夜孵育。加入终浓度100 mmol/L L-天冬氨酸钠和1 mmol/L PLP,于37 ℃,pH 6.5条件下反应10 min测定残余酶活。将初始酶活定义为100%,分析pH稳定性情况。

动力学常数测定。在终浓度50 μg/mL纯酶液中,分别加入终浓度5~100 mmol/L L-天冬氨酸钠、终浓度1 mmol/L PLP,于37 ℃,pH 6.5条件下,反应10 min检测β-丙氨酸产量,测定初始反应速率。采用GraphPad Prism软件拟合曲线,测定动力学常数Kmkcat

将在37 ℃,pH 6.5的条件下,每小时转化L-天冬氨酸钠生成1 mmol β-丙氨酸所需酶量定义为一个酶活力单位U。

2.4 全细胞催化合成β-丙氨酸的体系优化

以提高重组菌株的蛋白表达量及生物量为目的,在培养基中添加10和20 g/L葡萄糖,重组菌株经0.2 mmol/L IPTG,20 ℃诱导20 h后,冰浴破碎,利用质量浓度为12%的SDS-PAGE对重组酶的表达情况进行电泳检测。

重组菌细胞经培养诱导后,离心收集,浓缩到OD600=200。在10 mL反应液(pH 6.5)中,加入L-天冬氨酸钠固体粉末至终浓度1 mol/L,1 mmol/L PLP,反应温度为37 ℃,持续搅拌。每隔2 h取样测定L-天冬氨酸剩余量和β-丙氨酸的生成量。同时将不添加PLP的实验样品作为对照组。

3 结果

3.1 L-天冬氨酸-α-脱羧酶的表达与纯化

酶活与热稳定性初步筛选结果显示,红粉甲虫来源L-天冬氨酸-α-脱羧酶(TcADC)突变体K49R催化性能优良。本研究将其过量表达并分离纯化。分离纯化结果如图1所示,重组菌成功表达了野生型与突变体L-天冬氨酸-β-脱羧酶,且获得了电泳纯目的蛋白,分子量约为61 kDa。

图1 重组酶过量表达与纯化
Fig.1 Overexpression and purification of recombinant enzymes

3.2 突变体K49R的酶学性质表征

由图2-a可知,野生型的最适温度为37 ℃,突变体K49R的最适温度为42 ℃。在不同温度下处理酶30 min后测量其热稳定性,发现随着温度升高,野生型的酶活性降低,特别是在高于40 ℃时(图2-b)。在40 ℃处理后,野生型的活性保持在70%,而在50 ℃处理情况下,野生型仅剩余22%的酶活;而突变体K49R稳定性有所提高,50 ℃处理后仍剩余34%的酶活(图2-b)。

野生型与突变体K49R的最适pH均为6.5(图2-c)。在冰上在各种pH条件下孵育8 h后检测其pH稳定性,突变体K49R与野生型几乎无差异:在pH 6.0~7.0之间保持稳定,在pH低于5.5或高于7.5时,TcADC的剩余酶活低于75%(图2-d)。

a-最适温度;b-温度稳定性;c-最适pH;d-pH稳定性
图2 温度与pH对酶活力的影响
Fig.2 Effects of temperature and pH on enzymatic activity

测定突变体K49R的比活性和动力学参数(表1)并与野生型进行比较。野生型的比活性为290±9.5 U/g,Km为5.63±0.36 mmol/L,kcat为16.9±0.6 s-1。突变体K49R的Km值有大幅下降,表明其底物亲和力优于野生型;虽然kcat值略有下降,但是催化效率还是有显著提升,是野生型的1.8倍。

表1 动力学参数与比酶活
Table 1 Kinetic parameters and specific activities

酶Km/(mmol·L-1)kcat/(s-1)kcat/Km/(L·mmol-1·s-1)电活性/(U·g-1)TcADC5.63±0.3616.9±0.63.00290±9.5K49R2.66±0.2014.2±1.15.34269±5.0

3.3 全细胞催化合成β-丙氨酸

3.3.1 重组ADC表达条件的优化

以提高重组菌株的蛋白表达量及生物量为目的,在培养基中添加葡萄糖。培养、诱导表达后,蛋白表达情况如图3所示。添加10 g/L葡萄糖后,蛋白表达量有所增加,可溶性与沉淀中的蛋白量都随之增加。与添加20 g/L葡萄糖和未添加葡萄糖相比,添加量为10 g/L时,相同生物量的菌体内可溶性蛋白含量较高。另外,添加葡萄糖后,其生物量也从OD600 5.8提高到8.8。

图3 葡萄糖对重组ADC的影响
Fig.3 Effect of glucose on the expression of TcADC

3.3.2 PLP对全细胞催化反应的影响

TcADC为PLP依赖型酶,通过一次性加入高浓度底物的方法研究PLP对全细胞催化反应的影响。在含有重组大肠杆菌细胞(OD600=200)的反应液中,添加1 mol/L的L-天冬氨酸进行全细胞催化反应,定时取样监测的底物与产物的含量。结果如图3所示,添加1 mmol/L PLP的反应体系较快地完成了催化(图4-b),而未添加PLP的反应体系也能完成催化,但是生产效率较低(图4-a)。重组菌细胞内的PLP作为辅酶参与全细胞催化,而额外添加PLP可以大幅提高β-丙氨酸生产效率。添加2 mmol/L的PLP或每隔10 h添加1 mmol/L的PLP,催化效率几乎与添加1 mmol/L的PLP相同(数据未显示),表明在本全细胞催化体系中,一次性添加1 mmol/L的PLP可以满足辅酶的供应需求。

a-未添加PLP;b-添加1 mmol/L PLP
图4 PLP对全细胞催化合成β-丙氨酸的影响
Fig.4 Effect of PLP on β-alanine synthesis using whole-cell catalysis

4 结论

目前,由于ADC的催化能力有限,限制了工业上生物合成法生产β-丙氨酸。本研究对红粉甲虫L-天冬氨酸-β-脱羧酶的突变体K49R进行了酶学性质解析,发现其热稳定性较野生型有所提高,最适pH和pH稳定性与野生型相差无几。酶动力学测定结果显示其催化效率是野生型的1.8倍,推测是得益于其大幅提高底物亲和力。突变体K49R具有更优良的催化性能以及很大的工业应用潜力。全细胞催化合成β-丙氨酸体系优化结果显示,添加10 g/L葡萄糖可以将重组菌生物量提高0.5倍,重组酶的表达量也相应提升;添加适量PLP可以大幅缩短催化时间,提高β-丙氨酸的合成效率。

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Characterization of enzymatic properties of an insect-derived L-aspartate-α-decarboxylase variant

YE Wenqi, XUE Lan, WANG Chao, CUI Wenjing, ZHOU Zhemin, LIU Zhongmei*

(School of Biothechnology, Jiangnan University, Wuxi 214122, China)

ABSTRACT This study aimed to characterize the enzymatic properties of L-aspartate-α-decarboxylase (ADC) derived from red flour beetles in order to provide theoretical and technical support for β-alanine bioproduction. A mutant K49R derived from red flour beetles was purified and characterized, followed by conducting a whole-cell catalysis. It was found that the optimum reaction pH and temperature of K49R was 6.5 and 42 ℃, respectively, and the thermal stability of K49R was 1.7 times higher than that of the wild type. The substrate affinity of K49R was greatly improved, and the catalytic efficiency was 1.8 times higher that of the wild type. Additionally, the biomass of the recombinant Escherichia coli and the expression level of ADC were effectively increased by adding 10 g/L glucose into the medium. The addition of pyridoxal phosphate (PLP) shorted the reaction time and improved the catalytic efficiency. In conclusion, by construction of an engineered strain this study provides a green and efficient biosynthesis method to produce β-alanine, which lays an important foundation for industrializing the biosynthesis of L-aspartate.

Key words β-alanine; L-aspartate-α-decarboxylase; red flour beetle; thermal stability; whole-cell catalysis

DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.021344

第一作者:本科(刘中美副教授为通讯作者,E-mail:zliu@jiangnan.edu.cn)。

基金项目:国家重点研发计划政府间创新合作重点专项(2016YFE0127400);国家自然科学基金(3140078)

收稿日期:2019-06-12,改回日期:2019-07-09