采用琼脂糖凝胶电泳、核酸蛋白检测和聚合酶链反应扩增(polymerase chain reaction,PCR)检测DNA的浓度和纯度,对改良十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法与2种商业试剂盒提取4种不同品种酿酒葡萄DNA的方法进行了对比分析,结果表明改良的CTAB法提取DNA完整性较好,基因组DNA样品的OD260/OD280值均在1.8左右,4 个酿酒葡萄均能扩增出PCR条带,且条带清晰,无拖尾现象。说明改良的CTAB法提取的酿酒葡萄基因组DNA浓度和纯度均较高,可以进行PCR扩增、电泳检测、遗传多样性分析以及基因图谱构建等下游分子生物学研究试验。
An improved CTAB method was developed for efficient extraction of genomic DNA from four different types of grapes. The quality of DNA was detected by agarose gel electrophoresis and nucleic acid/protein analyzer. The ratio of OD260/OD280 of the extracted DNA reached 1.8. The DNA on agarose electrophoresis was clear and suitable as template for specific gene amplification. The quality of extracted DNA by the improved CTAB method reached the requirement of subsequent molecular biological researches, such as PCR amplification, restriction pattern analysis, genetic diversity analysis and genetic map construction.
[1] LI H, LI J, CONG X H, et al. A high-throughput, high-quality plant genomic DNA extraction protocol[J]. Genetics & Molecular Research, 2013, 12(4):4 526-4 539.
[2] 刘塔斯,林丽美,龚力民,等.分子标记中植物DNA提取方法的研究进展[J].中南药学,2005, 3(6):370-373.
[3] 高苏娟,李志勇,高东微,等.葡萄酒中葡萄的DNA提取和分子鉴定研究进展[J].食品科学, 2015, 36(15):282-287.
[4] 张璐璐,樊晨,樊哲,等. 改良CTAB法提取草莓基因组DNA[J]. 现代园艺, 2014(11):5-7.
[5] 中华人民共和国国家质量监督检验总局.SN/T 3729—2013出口食品及饮料中常见水果品种的鉴定方法第2部分:杏成分检测实时荧光PCR法[S].北京:中国标准出版社,2013.
[6] 李金璐,王硕,于婧,等.一种改良的植物DNA提取方法[J].植物学报, 2013, 48(1):72-78.
[7] 赵志常,陈业渊,高爱平,等.改良CTAB法提取番石榴总DNA的初步研究[J].北方园艺,2013(9):123-125.
[8] 陈林杨,宋敏舒,查红光,等.一种改良的植物基因组DNA通用提取方法[J].植物分类与资源学报, 2014,36(3):375-380.
[9] 段婧婧,肖琳,陈军.用于转基因检测的水果果肉总DNA提取法[J].食品科学,2009,30(3):230-233.
[10] 刘锴栋,袁长春,陈燕,等.不同方法提取野生荔枝基因组DNA效果的比较[J].北方园艺,2012(23):105-109.
[11] 高媛,杜国强,师校欣.适于转基因苹果种子和果肉总DNA提取的方法[J].中国农学通报, 2010, 26(16):238-241.
[12] 徐美隆,章雨,倪细炉.一种高质量葡萄基因组DNA提取方法[J].北方园艺, 2011(15):172-174.
[13] 齐玲倩,刘秀,丁梦璇,等.水果果肉中总DNA提取方法的比较研究[J].食品研究与开发,2016, 37(5):55-58.